198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  100 
 
 		 1022 aa  1946    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  39.89 
 
 		 1047 aa  466  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  33.92 
 
 		 1025 aa  318  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  30.22 
 
 		 953 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  28.09 
 
 		 1018 aa  272  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  28.19 
 
 		 1018 aa  266  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  25.35 
 
 		 1029 aa  259  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  25.51 
 
 		 1029 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.66 
 
 		 1029 aa  254  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  25.58 
 
 		 1029 aa  253  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.18 
 
 		 1029 aa  248  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  25.3 
 
 		 1029 aa  244  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  25.26 
 
 		 1029 aa  244  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  25.26 
 
 		 1029 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  25.47 
 
 		 1029 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  25.26 
 
 		 1029 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  51.24 
 
 		 1046 aa  230  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  45.67 
 
 		 962 aa  190  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  25.69 
 
 		 1049 aa  180  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.57 
 
 		 1291 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  40.25 
 
 		 881 aa  173  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  40.95 
 
 		 1249 aa  168  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  25.8 
 
 		 1046 aa  167  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  29.14 
 
 		 1018 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  31.27 
 
 		 1018 aa  164  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 1018 aa  164  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  29.14 
 
 		 1018 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  27.7 
 
 		 1018 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  30.47 
 
 		 1020 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  24.44 
 
 		 1039 aa  157  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  29.6 
 
 		 1018 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  37.08 
 
 		 989 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  30.09 
 
 		 1018 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  35.88 
 
 		 1023 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  32.02 
 
 		 986 aa  149  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 		 1029 aa  148  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  36.07 
 
 		 1081 aa  146  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  35.96 
 
 		 1018 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  31.58 
 
 		 1013 aa  144  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 1018 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 1018 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  42.11 
 
 		 1018 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.8 
 
 		 1059 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 1018 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  42.11 
 
 		 1018 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  43 
 
 		 1191 aa  141  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  31.87 
 
 		 1020 aa  138  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  33.62 
 
 		 1038 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  23.47 
 
 		 1009 aa  135  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  48.19 
 
 		 995 aa  136  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  32.88 
 
 		 1009 aa  134  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  32.88 
 
 		 1009 aa  134  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  33.19 
 
 		 1030 aa  130  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  34.61 
 
 		 1009 aa  128  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  25.7 
 
 		 1032 aa  126  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  27.69 
 
 		 1085 aa  121  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  48.8 
 
 		 1058 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  43.07 
 
 		 986 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  40.87 
 
 		 1017 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  46.63 
 
 		 995 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  44.19 
 
 		 1020 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  41.52 
 
 		 1011 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.95 
 
 		 1108 aa  112  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  31.27 
 
 		 1226 aa  111  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  41.57 
 
 		 1214 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  35.68 
 
 		 1165 aa  110  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  27.14 
 
 		 1091 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  27.2 
 
 		 1091 aa  110  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  40.96 
 
 		 1214 aa  109  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 810 aa  109  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  32.76 
 
 		 1219 aa  108  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  34.68 
 
 		 1033 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  41.94 
 
 		 1214 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  35.19 
 
 		 1214 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  41.06 
 
 		 1213 aa  105  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  41.94 
 
 		 1214 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  41.94 
 
 		 1214 aa  105  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  36.27 
 
 		 1211 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  36.27 
 
 		 1211 aa  104  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  38.69 
 
 		 1234 aa  104  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  44.44 
 
 		 1006 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  40.91 
 
 		 1024 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  44.6 
 
 		 1101 aa  102  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  29.91 
 
 		 1223 aa  101  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  35.47 
 
 		 824 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  35.92 
 
 		 1116 aa  100  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  30.7 
 
 		 1223 aa  99.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  33.99 
 
 		 1114 aa  99.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  31.7 
 
 		 1224 aa  99  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  29.53 
 
 		 1088 aa  98.6  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  35.29 
 
 		 1223 aa  98.6  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  27.72 
 
 		 1164 aa  97.8  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  31.4 
 
 		 1172 aa  96.3  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  37.58 
 
 		 1230 aa  96.3  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  30.85 
 
 		 1180 aa  95.9  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  31.4 
 
 		 1172 aa  95.5  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  35.15 
 
 		 1346 aa  94  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  35 
 
 		 1103 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  28.57 
 
 		 1046 aa  93.2  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  28.79 
 
 		 1182 aa  93.2  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>