202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2822 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1020 aa  1987    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  39.85 
 
 		 1020 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  33.3 
 
 		 1018 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  33.62 
 
 		 1018 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  33.55 
 
 		 1018 aa  485  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  34.66 
 
 		 1018 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  33.74 
 
 		 1018 aa  476  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  32.85 
 
 		 1018 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  33.4 
 
 		 1018 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  33.81 
 
 		 1018 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  32.29 
 
 		 1018 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  33.69 
 
 		 1018 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  33.91 
 
 		 1018 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  33.91 
 
 		 1018 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  33.91 
 
 		 1018 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  32.51 
 
 		 1018 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  32.95 
 
 		 1013 aa  439  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.52 
 
 		 1049 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  27.19 
 
 		 1039 aa  403  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.79 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.11 
 
 		 1029 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  29.28 
 
 		 1029 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  28.22 
 
 		 1029 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.2 
 
 		 1029 aa  366  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.03 
 
 		 1029 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  28.73 
 
 		 1029 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  28.73 
 
 		 1029 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.22 
 
 		 1029 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.32 
 
 		 1029 aa  354  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.12 
 
 		 1029 aa  351  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.87 
 
 		 1038 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.99 
 
 		 1024 aa  322  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 		 1033 aa  296  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  33.7 
 
 		 1020 aa  264  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  54.58 
 
 		 1017 aa  258  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  25.2 
 
 		 1011 aa  242  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  27.12 
 
 		 1091 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  35.88 
 
 		 1018 aa  208  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  29.35 
 
 		 953 aa  188  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  32.04 
 
 		 1025 aa  176  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  46.15 
 
 		 962 aa  169  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  33.02 
 
 		 1047 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  43.5 
 
 		 995 aa  165  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  43.61 
 
 		 1081 aa  164  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  43.99 
 
 		 986 aa  163  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  34.09 
 
 		 989 aa  162  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  25.33 
 
 		 1009 aa  161  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  41.12 
 
 		 1291 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  50.72 
 
 		 1006 aa  161  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  38.93 
 
 		 881 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  38.16 
 
 		 1009 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  38.16 
 
 		 1009 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  28.28 
 
 		 1091 aa  148  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  41.38 
 
 		 1023 aa  147  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  36.41 
 
 		 1046 aa  146  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  27.55 
 
 		 1088 aa  144  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  48.09 
 
 		 986 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  49 
 
 		 1249 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  38 
 
 		 1046 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  46.5 
 
 		 1191 aa  139  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  49.7 
 
 		 995 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  39.34 
 
 		 1022 aa  128  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  34.55 
 
 		 1223 aa  127  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.81 
 
 		 1059 aa  126  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  50.62 
 
 		 1058 aa  125  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.87 
 
 		 1030 aa  125  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 1224 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  31.21 
 
 		 1223 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  42.86 
 
 		 1101 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  46.3 
 
 		 1009 aa  118  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  34.15 
 
 		 1230 aa  118  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  31.35 
 
 		 1346 aa  117  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  30.14 
 
 		 1226 aa  114  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  39.89 
 
 		 1214 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.96 
 
 		 1108 aa  111  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  39.89 
 
 		 1214 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  39.89 
 
 		 1214 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  39.89 
 
 		 1211 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  39.89 
 
 		 1211 aa  110  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  33.51 
 
 		 1172 aa  109  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  39.89 
 
 		 1214 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  28.27 
 
 		 906 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  38.42 
 
 		 824 aa  108  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  29.5 
 
 		 1165 aa  108  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  35.12 
 
 		 810 aa  107  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  32.99 
 
 		 1172 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.3 
 
 		 1180 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  43.14 
 
 		 1214 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  28.33 
 
 		 1307 aa  105  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  41.83 
 
 		 1213 aa  105  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  35.2 
 
 		 1303 aa  105  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  25.4 
 
 		 1219 aa  104  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  34.74 
 
 		 1116 aa  104  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  42.48 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  29.28 
 
 		 1085 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  35.32 
 
 		 824 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  34.93 
 
 		 1137 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  35.44 
 
 		 815 aa  99.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  33.85 
 
 		 1114 aa  99  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  35.32 
 
 		 1099 aa  98.6  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>