190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1443 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  100 
 
 		 1046 aa  2091    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.18 
 
 		 1059 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  28.7 
 
 		 1018 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26.34 
 
 		 1029 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.82 
 
 		 1018 aa  253  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  26.87 
 
 		 1029 aa  241  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.49 
 
 		 1030 aa  164  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  38.77 
 
 		 1020 aa  160  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  27.85 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  42.25 
 
 		 1006 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  40.4 
 
 		 1018 aa  153  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  27.37 
 
 		 1029 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  39.11 
 
 		 1022 aa  148  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  37.14 
 
 		 1018 aa  147  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  27.19 
 
 		 1029 aa  147  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  31.67 
 
 		 1018 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  36.41 
 
 		 1020 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  44.19 
 
 		 1033 aa  144  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  27.01 
 
 		 1029 aa  144  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  27.01 
 
 		 1029 aa  144  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  38.97 
 
 		 953 aa  144  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.83 
 
 		 1029 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  36.67 
 
 		 1018 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  34.43 
 
 		 1029 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  26.83 
 
 		 1029 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  41.36 
 
 		 962 aa  142  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  40 
 
 		 986 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  34.07 
 
 		 1029 aa  139  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  37.77 
 
 		 1020 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  38.97 
 
 		 1024 aa  135  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  36.17 
 
 		 989 aa  134  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  32.08 
 
 		 1081 aa  132  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  29.17 
 
 		 1039 aa  132  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  36.7 
 
 		 995 aa  131  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  26.68 
 
 		 1018 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  27.21 
 
 		 1049 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  37.23 
 
 		 1017 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  26.68 
 
 		 1018 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  34.03 
 
 		 1018 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  26.68 
 
 		 1018 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  34.27 
 
 		 1009 aa  127  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  34.27 
 
 		 1009 aa  127  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  37.7 
 
 		 1291 aa  125  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  33.82 
 
 		 1018 aa  125  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  35.21 
 
 		 1018 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  41.45 
 
 		 1025 aa  123  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  34.88 
 
 		 1009 aa  122  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  31.64 
 
 		 1047 aa  120  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  34.72 
 
 		 1018 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  37.65 
 
 		 881 aa  118  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  34.22 
 
 		 1018 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  35.27 
 
 		 1013 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  34.5 
 
 		 1046 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  37.04 
 
 		 995 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  26.41 
 
 		 1009 aa  114  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  40.36 
 
 		 1038 aa  111  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  39.13 
 
 		 1011 aa  111  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  35.2 
 
 		 1023 aa  111  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  30.97 
 
 		 1211 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  35.75 
 
 		 1211 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  35.45 
 
 		 986 aa  107  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  37.79 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  39.46 
 
 		 1214 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  39.78 
 
 		 1101 aa  106  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  39.46 
 
 		 1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  39.46 
 
 		 1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  36.71 
 
 		 961 aa  105  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  32.08 
 
 		 1182 aa  104  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  39.89 
 
 		 1214 aa  104  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  39.55 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  38.42 
 
 		 1249 aa  104  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  39.77 
 
 		 1213 aa  101  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  30.29 
 
 		 906 aa  99.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  39.29 
 
 		 1191 aa  99  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  32.67 
 
 		 1224 aa  98.2  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  34.09 
 
 		 1226 aa  97.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  37.58 
 
 		 1234 aa  97.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  40.85 
 
 		 1058 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.46 
 
 		 1219 aa  95.9  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  30.2 
 
 		 1223 aa  95.5  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  31.36 
 
 		 810 aa  95.1  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  35.68 
 
 		 1303 aa  95.1  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  36.22 
 
 		 1307 aa  94  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  32.64 
 
 		 1099 aa  91.3  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  33.88 
 
 		 1346 aa  90.9  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  35.59 
 
 		 1244 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.97 
 
 		 1108 aa  90.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  31.14 
 
 		 1223 aa  90.1  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  40.52 
 
 		 1230 aa  89  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 1180 aa  87  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  37.8 
 
 		 1245 aa  84.7  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  25.39 
 
 		 1029 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  32.11 
 
 		 1114 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  30.65 
 
 		 815 aa  83.2  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  32.45 
 
 		 1116 aa  82  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  34.55 
 
 		 1229 aa  82  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  34.55 
 
 		 1229 aa  82  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  34.55 
 
 		 1220 aa  82  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  37.04 
 
 		 910 aa  81.6  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>