More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0823 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  100 
 
 		 910 aa  1764    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  35.6 
 
 		 906 aa  422  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  37.02 
 
 		 904 aa  382  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.69 
 
 		 1029 aa  209  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  24.41 
 
 		 1029 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  24.31 
 
 		 1029 aa  195  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  24.6 
 
 		 1029 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 1018 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  26.09 
 
 		 1018 aa  180  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  25.38 
 
 		 1018 aa  160  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  32.39 
 
 		 961 aa  150  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  34.85 
 
 		 810 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  39.21 
 
 		 824 aa  131  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  34.63 
 
 		 1099 aa  126  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  47.29 
 
 		 824 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  39.9 
 
 		 1103 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  39.78 
 
 		 815 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  26.39 
 
 		 1022 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  31.65 
 
 		 1114 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  26.75 
 
 		 1108 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 		 1180 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  26.54 
 
 		 1029 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.54 
 
 		 1029 aa  115  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  38.35 
 
 		 1223 aa  115  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  26.32 
 
 		 1029 aa  115  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.37 
 
 		 1029 aa  115  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  28.2 
 
 		 1048 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  26.32 
 
 		 1029 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.32 
 
 		 1029 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.32 
 
 		 1029 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  34.87 
 
 		 1116 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  33.07 
 
 		 1047 aa  111  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  33.07 
 
 		 1047 aa  111  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  33.07 
 
 		 1047 aa  111  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  33.07 
 
 		 1047 aa  111  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  33.07 
 
 		 1048 aa  111  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  33.07 
 
 		 1048 aa  111  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  33.07 
 
 		 1047 aa  111  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  25.61 
 
 		 1018 aa  111  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  33.07 
 
 		 1047 aa  111  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  35.91 
 
 		 1165 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  34.22 
 
 		 1003 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  23.19 
 
 		 1009 aa  109  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  28.3 
 
 		 1172 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  29.02 
 
 		 953 aa  108  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  27.58 
 
 		 1018 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  27.58 
 
 		 1018 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  27.58 
 
 		 1018 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  34.25 
 
 		 1172 aa  108  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  49.07 
 
 		 1234 aa  108  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  42.24 
 
 		 989 aa  107  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  28.88 
 
 		 1018 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  38.1 
 
 		 1091 aa  106  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  42.54 
 
 		 1219 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  35.57 
 
 		 1020 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  35.08 
 
 		 1029 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  33.49 
 
 		 1155 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  37.04 
 
 		 1091 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  39.6 
 
 		 962 aa  105  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  27.25 
 
 		 1088 aa  104  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  32.65 
 
 		 1214 aa  104  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  30.96 
 
 		 1232 aa  104  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  40.24 
 
 		 1025 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  32.39 
 
 		 1226 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  32.92 
 
 		 1227 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  34.65 
 
 		 1227 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  31.45 
 
 		 1018 aa  102  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  33.73 
 
 		 1265 aa  102  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  44.12 
 
 		 1101 aa  101  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  43.04 
 
 		 995 aa  102  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 1018 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  36.53 
 
 		 1346 aa  101  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  34.78 
 
 		 1227 aa  100  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  30.88 
 
 		 1303 aa  100  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  34.93 
 
 		 1211 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  45.93 
 
 		 1058 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  44.95 
 
 		 1223 aa  99.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  30.63 
 
 		 1214 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  25.86 
 
 		 1085 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  41.57 
 
 		 986 aa  99.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  34.3 
 
 		 1227 aa  100  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  42.28 
 
 		 1211 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  30.69 
 
 		 1011 aa  100  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  35.93 
 
 		 1307 aa  99.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  30.95 
 
 		 1247 aa  99  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  34.07 
 
 		 1017 aa  99  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  27.03 
 
 		 1018 aa  99.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  31.96 
 
 		 1230 aa  99.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  30.56 
 
 		 1144 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  33.02 
 
 		 1232 aa  99  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  41.35 
 
 		 1018 aa  98.6  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  39.42 
 
 		 1018 aa  98.6  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  30.14 
 
 		 1227 aa  98.6  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  39.71 
 
 		 1018 aa  98.2  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  34.78 
 
 		 1137 aa  98.2  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  32.08 
 
 		 1165 aa  97.8  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  40 
 
 		 1047 aa  98.2  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  30.35 
 
 		 1022 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  32.98 
 
 		 1081 aa  97.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  33.97 
 
 		 1164 aa  96.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>