194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2702 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  100 
 
 		 881 aa  1684    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  39.84 
 
 		 986 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  37.7 
 
 		 989 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  27.66 
 
 		 1018 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  38.31 
 
 		 995 aa  251  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  59.07 
 
 		 1025 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  50.15 
 
 		 1249 aa  243  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  52.47 
 
 		 1291 aa  234  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 1023 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  37.33 
 
 		 962 aa  224  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  50.66 
 
 		 986 aa  208  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  37.66 
 
 		 1058 aa  207  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  57.27 
 
 		 1191 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  43.03 
 
 		 995 aa  194  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.85 
 
 		 1018 aa  192  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  45.59 
 
 		 1020 aa  188  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  41.01 
 
 		 1017 aa  177  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  30.44 
 
 		 953 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  28.6 
 
 		 1018 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  39.44 
 
 		 1018 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  59.88 
 
 		 1009 aa  174  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  24.07 
 
 		 1009 aa  172  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  40.25 
 
 		 1022 aa  172  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  36.66 
 
 		 1047 aa  171  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  28.91 
 
 		 1018 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  39.91 
 
 		 1013 aa  168  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  40.46 
 
 		 1046 aa  168  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  46.88 
 
 		 1006 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  32.92 
 
 		 1018 aa  167  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  27.53 
 
 		 1018 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  37.62 
 
 		 1020 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  32.61 
 
 		 1018 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  28.55 
 
 		 1018 aa  164  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  36.65 
 
 		 1018 aa  162  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  32.92 
 
 		 1018 aa  158  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  27.27 
 
 		 1029 aa  157  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.46 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.46 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  27.93 
 
 		 1029 aa  156  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  38.48 
 
 		 1020 aa  155  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  33.79 
 
 		 1018 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  33.79 
 
 		 1018 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  26.46 
 
 		 1029 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  42.55 
 
 		 1009 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  42.55 
 
 		 1009 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.46 
 
 		 1029 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  26.64 
 
 		 1029 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  26.46 
 
 		 1029 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  38.69 
 
 		 1081 aa  153  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26.28 
 
 		 1029 aa  151  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  26.46 
 
 		 1029 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  39.34 
 
 		 1039 aa  150  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  41.1 
 
 		 1030 aa  148  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.64 
 
 		 1029 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  24.36 
 
 		 1049 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  35.84 
 
 		 1018 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  34.04 
 
 		 1018 aa  142  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  35.89 
 
 		 1038 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  28.47 
 
 		 1024 aa  135  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  34.57 
 
 		 1033 aa  127  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  39.66 
 
 		 1059 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  37.65 
 
 		 1046 aa  118  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  35.53 
 
 		 1011 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  45.78 
 
 		 1101 aa  114  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.98 
 
 		 906 aa  114  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  43.35 
 
 		 1214 aa  111  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  46.98 
 
 		 1214 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  45.51 
 
 		 1213 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  29.74 
 
 		 1346 aa  109  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  44.08 
 
 		 1211 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  44.08 
 
 		 1211 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  39.18 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  38.66 
 
 		 1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  47.86 
 
 		 1227 aa  106  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  39.29 
 
 		 1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  38.78 
 
 		 1214 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  36.7 
 
 		 1307 aa  105  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  36.81 
 
 		 1303 aa  104  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  39 
 
 		 1155 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  39.58 
 
 		 1226 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  41.43 
 
 		 1234 aa  101  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  20.75 
 
 		 961 aa  100  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  38.69 
 
 		 1219 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  36.9 
 
 		 1091 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  42.22 
 
 		 1223 aa  99.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.67 
 
 		 1180 aa  99.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  39.1 
 
 		 1088 aa  99  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  40 
 
 		 1116 aa  98.6  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  37.97 
 
 		 1230 aa  98.2  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  40.11 
 
 		 1226 aa  98.2  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  46.43 
 
 		 1227 aa  97.4  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  32.19 
 
 		 1114 aa  97.8  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  29.47 
 
 		 1232 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  28.85 
 
 		 1085 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  35.68 
 
 		 815 aa  96.3  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  31.25 
 
 		 1172 aa  96.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  39.58 
 
 		 1224 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  43.33 
 
 		 1164 aa  96.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  39.78 
 
 		 1238 aa  96.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  32.37 
 
 		 810 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>