184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_08420 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  100 
 
 
1009 aa  1884    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  28.69 
 
 
1018 aa  269  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  26.64 
 
 
1018 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  38.34 
 
 
995 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  49.35 
 
 
881 aa  204  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  40.33 
 
 
1025 aa  196  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  45.95 
 
 
1023 aa  194  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  40.04 
 
 
986 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.64 
 
 
1013 aa  190  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  35.86 
 
 
989 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  31.47 
 
 
1018 aa  174  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  31.39 
 
 
1020 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  31.75 
 
 
953 aa  173  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  55.69 
 
 
1291 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 
1018 aa  173  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  27.6 
 
 
1018 aa  171  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  58.99 
 
 
986 aa  170  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  22.96 
 
 
1011 aa  170  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  28.18 
 
 
1018 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  53.18 
 
 
1047 aa  164  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  28.18 
 
 
1018 aa  164  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  28.03 
 
 
1018 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  34.92 
 
 
1022 aa  161  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  38.39 
 
 
995 aa  158  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  55.08 
 
 
962 aa  158  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  55.28 
 
 
1191 aa  158  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  34.22 
 
 
1018 aa  154  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  45 
 
 
1249 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  51.22 
 
 
1046 aa  153  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  25.39 
 
 
1029 aa  152  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  26.01 
 
 
1029 aa  152  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  25.55 
 
 
1029 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  24.78 
 
 
1029 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  36.18 
 
 
1018 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  26.49 
 
 
1029 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  36.64 
 
 
1018 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  38.46 
 
 
1030 aa  149  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  31.54 
 
 
1009 aa  149  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  26.06 
 
 
1029 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.26 
 
 
1029 aa  147  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  40.09 
 
 
1018 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.57 
 
 
1029 aa  146  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.57 
 
 
1029 aa  146  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  26.57 
 
 
1029 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  25.83 
 
 
1029 aa  145  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  32.95 
 
 
1009 aa  145  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  32.95 
 
 
1009 aa  145  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  54.6 
 
 
1058 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  27.68 
 
 
1018 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  44.75 
 
 
1039 aa  140  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  40.82 
 
 
1024 aa  135  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  40.19 
 
 
1049 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  49.7 
 
 
1006 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  36.24 
 
 
1020 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  44.38 
 
 
1018 aa  128  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  41.77 
 
 
1038 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  50.62 
 
 
1017 aa  127  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  39.46 
 
 
1020 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  21.32 
 
 
1046 aa  125  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  33.17 
 
 
1018 aa  119  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  28.16 
 
 
906 aa  117  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  33.5 
 
 
1059 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  31.25 
 
 
1081 aa  113  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  34.22 
 
 
1033 aa  106  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  34.76 
 
 
1180 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  34.34 
 
 
810 aa  102  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  45.22 
 
 
1214 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.93 
 
 
1019 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  45.22 
 
 
1214 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  37.8 
 
 
1101 aa  99.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  44.35 
 
 
1214 aa  99  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  43.22 
 
 
1213 aa  99  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  33.88 
 
 
910 aa  99  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  44.35 
 
 
1214 aa  99  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  44.54 
 
 
1211 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  44.54 
 
 
1211 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  44.35 
 
 
1214 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  44.35 
 
 
1214 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  39.46 
 
 
1224 aa  97.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  33.68 
 
 
1114 aa  97.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  27.72 
 
 
1108 aa  97.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  31.72 
 
 
1172 aa  96.3  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  30.43 
 
 
1172 aa  95.9  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  32.61 
 
 
1165 aa  94.7  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  25.41 
 
 
1085 aa  94.7  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  35 
 
 
815 aa  94.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  37.93 
 
 
1307 aa  93.2  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  46.08 
 
 
1223 aa  93.2  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  37.93 
 
 
1303 aa  92.8  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  35.29 
 
 
1223 aa  92.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  37.23 
 
 
1091 aa  91.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  37.93 
 
 
1226 aa  90.9  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  36.14 
 
 
1164 aa  90.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  34.25 
 
 
851 aa  89.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  37.96 
 
 
1230 aa  89.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  50 
 
 
1227 aa  89.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  29.49 
 
 
1091 aa  89.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  42.48 
 
 
1346 aa  89  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  33.84 
 
 
824 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  35.71 
 
 
1116 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>