More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0982 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  49.84 
 
 		 904 aa  707    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 906 aa  1774    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  27.86 
 
 		 961 aa  269  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  37.5 
 
 		 910 aa  263  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  25.05 
 
 		 1029 aa  209  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  24.78 
 
 		 1029 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  24.78 
 
 		 1029 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  24.86 
 
 		 1029 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.41 
 
 		 1029 aa  207  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  24.85 
 
 		 1029 aa  206  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  24.86 
 
 		 1029 aa  206  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.84 
 
 		 1029 aa  205  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  25.17 
 
 		 1029 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  24.45 
 
 		 1029 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.03 
 
 		 1029 aa  190  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  25.58 
 
 		 1018 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  26.3 
 
 		 1018 aa  187  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  21.47 
 
 		 1009 aa  178  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  26.88 
 
 		 1085 aa  172  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.7 
 
 		 1018 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  26.02 
 
 		 1024 aa  148  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  25.68 
 
 		 859 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  25.33 
 
 		 1180 aa  138  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  25.45 
 
 		 1016 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  23.07 
 
 		 1011 aa  135  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  24.41 
 
 		 859 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  30.09 
 
 		 810 aa  129  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.33 
 
 		 1030 aa  128  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  35.6 
 
 		 1114 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  32.99 
 
 		 815 aa  120  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  25.64 
 
 		 852 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  27.53 
 
 		 1108 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  36 
 
 		 824 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  27.24 
 
 		 1029 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  30.62 
 
 		 1165 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.59 
 
 		 1059 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  26.58 
 
 		 852 aa  118  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  23.36 
 
 		 1039 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  26.73 
 
 		 1018 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  29.79 
 
 		 1018 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  37.17 
 
 		 1116 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  28.9 
 
 		 1025 aa  114  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  26.15 
 
 		 1018 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  32.37 
 
 		 1219 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  24.33 
 
 		 1009 aa  111  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  24.33 
 
 		 1009 aa  111  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  35 
 
 		 824 aa  111  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  28.21 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  28.49 
 
 		 1020 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  23.4 
 
 		 1007 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  27.82 
 
 		 1091 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  27.24 
 
 		 1031 aa  109  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  31.56 
 
 		 1018 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  31.56 
 
 		 1018 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  31.56 
 
 		 1018 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  32.09 
 
 		 1099 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  28.97 
 
 		 1019 aa  108  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  44.9 
 
 		 1234 aa  108  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  30.65 
 
 		 1223 aa  108  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  28.96 
 
 		 1307 aa  107  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  35.1 
 
 		 1020 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  33.45 
 
 		 1303 aa  106  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  25.94 
 
 		 1018 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  37.95 
 
 		 881 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.06 
 
 		 1018 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  23.32 
 
 		 1061 aa  105  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  39.56 
 
 		 851 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  33.64 
 
 		 1023 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  28.75 
 
 		 1346 aa  103  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  36.36 
 
 		 1155 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  33.79 
 
 		 1223 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  41.88 
 
 		 995 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  42.25 
 
 		 1103 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  30.9 
 
 		 1048 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1048 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  32.38 
 
 		 1172 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  30.9 
 
 		 1048 aa  101  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  31.36 
 
 		 1047 aa  101  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  38.22 
 
 		 1046 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  38.22 
 
 		 1046 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  38.22 
 
 		 1046 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  37.14 
 
 		 1238 aa  101  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  30.93 
 
 		 1018 aa  100  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  27.5 
 
 		 1091 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  31.9 
 
 		 1172 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.67 
 
 		 1049 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  38.5 
 
 		 1227 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  45.07 
 
 		 1042 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  37.78 
 
 		 1046 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  37.39 
 
 		 1227 aa  99.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  31.01 
 
 		 1047 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  31.01 
 
 		 1047 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  31.01 
 
 		 1047 aa  99.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  27.65 
 
 		 1013 aa  100  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  31.01 
 
 		 1047 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  30.36 
 
 		 1018 aa  99.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  37.78 
 
 		 1046 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  26.9 
 
 		 1032 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.15 
 
 		 1038 aa  99  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  34.98 
 
 		 1230 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>