266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1488 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  56.99 
 
 
1116 aa  1133    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  100 
 
 
1114 aa  2194    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  29.51 
 
 
1108 aa  439  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  29.32 
 
 
1180 aa  416  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  57.5 
 
 
1223 aa  220  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  29.66 
 
 
1172 aa  207  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  30.23 
 
 
1172 aa  202  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  44.57 
 
 
1165 aa  199  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.31 
 
 
1018 aa  190  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  27.77 
 
 
1137 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  35.6 
 
 
906 aa  140  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  28.98 
 
 
1020 aa  138  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  25.47 
 
 
1029 aa  136  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.03 
 
 
1029 aa  135  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  26.39 
 
 
1029 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  26.15 
 
 
1032 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  25.81 
 
 
1029 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  26.42 
 
 
1029 aa  129  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  25.93 
 
 
1029 aa  127  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  26.44 
 
 
1018 aa  127  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  26.28 
 
 
1018 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  29.74 
 
 
1029 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  34.87 
 
 
910 aa  122  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  34.69 
 
 
1099 aa  120  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  30.19 
 
 
1046 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  34.27 
 
 
824 aa  119  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  34.55 
 
 
824 aa  119  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  23.37 
 
 
1039 aa  117  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  33.22 
 
 
1018 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.73 
 
 
1029 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  29.87 
 
 
1046 aa  117  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  29.87 
 
 
1046 aa  117  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  29.87 
 
 
1046 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.69 
 
 
1029 aa  115  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  26.63 
 
 
1213 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  31.83 
 
 
1018 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  29.41 
 
 
1029 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  31.02 
 
 
1013 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.06 
 
 
1029 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.06 
 
 
1029 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  29.25 
 
 
1046 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  26.25 
 
 
1047 aa  112  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  26.25 
 
 
1047 aa  112  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.85 
 
 
1030 aa  111  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  34.52 
 
 
961 aa  111  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  29.97 
 
 
1018 aa  111  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  34.04 
 
 
953 aa  110  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  23.77 
 
 
1011 aa  109  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  32.19 
 
 
881 aa  110  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  33 
 
 
1018 aa  110  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  28.74 
 
 
810 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  24.7 
 
 
1059 aa  108  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  33.98 
 
 
1018 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  32.57 
 
 
1048 aa  106  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  32.72 
 
 
1048 aa  106  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  32.57 
 
 
1047 aa  106  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  32.57 
 
 
1047 aa  106  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  32.57 
 
 
1048 aa  106  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  37.02 
 
 
1024 aa  105  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  33.76 
 
 
904 aa  105  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  32.11 
 
 
1047 aa  105  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  32.62 
 
 
1232 aa  105  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  35 
 
 
1047 aa  105  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  32.11 
 
 
1047 aa  105  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  33.04 
 
 
1017 aa  104  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  36.17 
 
 
1006 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  32.63 
 
 
1046 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  25.69 
 
 
1088 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  33.51 
 
 
1291 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  33.18 
 
 
1042 aa  102  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  28.37 
 
 
1224 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  25.35 
 
 
1081 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  30.39 
 
 
1211 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  30.07 
 
 
1009 aa  99.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  28.52 
 
 
1308 aa  99.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  27.36 
 
 
1232 aa  99.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  35.39 
 
 
851 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  33.99 
 
 
1022 aa  99  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  33.85 
 
 
1020 aa  98.2  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  32.98 
 
 
1020 aa  97.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  28.34 
 
 
1227 aa  97.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  33.68 
 
 
1009 aa  97.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  28.37 
 
 
1238 aa  96.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  23.02 
 
 
1223 aa  96.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  31.31 
 
 
995 aa  96.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  31.18 
 
 
1227 aa  97.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  35.05 
 
 
1025 aa  96.3  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  30.74 
 
 
989 aa  96.3  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  26.74 
 
 
950 aa  96.3  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  38.86 
 
 
1219 aa  95.9  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  34.45 
 
 
1214 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  44.62 
 
 
1009 aa  95.1  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  44.62 
 
 
1009 aa  95.1  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  33.86 
 
 
1265 aa  95.1  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  29.58 
 
 
1083 aa  94.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  24.7 
 
 
1091 aa  94  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  28.9 
 
 
1307 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  30.32 
 
 
986 aa  93.6  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  31.23 
 
 
1214 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  26.17 
 
 
1303 aa  92.8  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>