208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2843 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  100 
 
 		 1018 aa  2036    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  62.87 
 
 		 1018 aa  1110    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  54.48 
 
 		 1018 aa  976    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  79.67 
 
 		 1018 aa  1471    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  79.76 
 
 		 1018 aa  1530    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  80.16 
 
 		 1018 aa  1487    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  45.56 
 
 		 1020 aa  724    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  62.38 
 
 		 1018 aa  1108    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  51.18 
 
 		 1018 aa  875    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  62.87 
 
 		 1018 aa  1109    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  62.57 
 
 		 1018 aa  1080    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  62.97 
 
 		 1018 aa  1112    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  53.33 
 
 		 1018 aa  941    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  54.62 
 
 		 1018 aa  974    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  39.47 
 
 		 1018 aa  571  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  39.88 
 
 		 1013 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  38.4 
 
 		 1018 aa  545  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  33.24 
 
 		 1020 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  34.76 
 
 		 1017 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.97 
 
 		 1029 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.77 
 
 		 1029 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  28.68 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  28.54 
 
 		 1029 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  28.54 
 
 		 1029 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  29.53 
 
 		 1039 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  28.53 
 
 		 1029 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  28.53 
 
 		 1029 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.83 
 
 		 1049 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.2 
 
 		 1029 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.34 
 
 		 1029 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.34 
 
 		 1029 aa  376  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.24 
 
 		 1029 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  29.22 
 
 		 1038 aa  341  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.78 
 
 		 1024 aa  295  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  26.1 
 
 		 1009 aa  287  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  26.1 
 
 		 1009 aa  287  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  25.68 
 
 		 1011 aa  259  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  33.96 
 
 		 1020 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  35.21 
 
 		 1033 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31 
 
 		 1030 aa  206  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  52.06 
 
 		 953 aa  197  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  42.32 
 
 		 1081 aa  185  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.36 
 
 		 1009 aa  181  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  47.44 
 
 		 1006 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  34.91 
 
 		 995 aa  170  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  33.15 
 
 		 995 aa  167  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  48.48 
 
 		 1025 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  37.25 
 
 		 989 aa  152  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  47.7 
 
 		 986 aa  151  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  34.84 
 
 		 881 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  45.81 
 
 		 986 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.18 
 
 		 1291 aa  148  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  37.14 
 
 		 1046 aa  147  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  41.05 
 
 		 1022 aa  147  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  46.07 
 
 		 1023 aa  145  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  38.74 
 
 		 962 aa  145  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  43.86 
 
 		 1047 aa  144  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  28.5 
 
 		 1114 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  39.55 
 
 		 1046 aa  135  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  44.61 
 
 		 1058 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  37.04 
 
 		 1249 aa  129  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  33.22 
 
 		 1223 aa  127  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  44.03 
 
 		 1191 aa  125  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  27.02 
 
 		 1091 aa  124  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  32.9 
 
 		 1219 aa  124  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.84 
 
 		 1059 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.67 
 
 		 906 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  34.8 
 
 		 1211 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  35.4 
 
 		 1211 aa  118  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  30.08 
 
 		 1165 aa  118  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  39.01 
 
 		 1346 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  35.45 
 
 		 1116 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  27.27 
 
 		 1088 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  35.64 
 
 		 815 aa  112  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  39.69 
 
 		 1137 aa  111  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  31.98 
 
 		 1009 aa  110  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  30.99 
 
 		 1303 aa  109  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  37.57 
 
 		 1234 aa  108  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  35.45 
 
 		 1238 aa  108  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 810 aa  108  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  33.68 
 
 		 1172 aa  106  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  33.68 
 
 		 1172 aa  107  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  35.05 
 
 		 1230 aa  107  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  31.82 
 
 		 1164 aa  106  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  30.45 
 
 		 1307 aa  105  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 		 1224 aa  105  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  34.2 
 
 		 1226 aa  104  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  37.99 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  36.29 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  34.02 
 
 		 1091 aa  104  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  37.99 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  37.99 
 
 		 1214 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  32.9 
 
 		 1227 aa  102  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  37.76 
 
 		 1214 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  33.6 
 
 		 1155 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  39.53 
 
 		 1213 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  37.43 
 
 		 1101 aa  102  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  37.43 
 
 		 1214 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  31.86 
 
 		 1180 aa  102  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  36.78 
 
 		 1223 aa  101  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>