239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0207 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1172 aa  2222    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  96.67 
 
 		 1172 aa  2029    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  42.18 
 
 		 1165 aa  798    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  34.04 
 
 		 1108 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  36.6 
 
 		 1180 aa  485  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  29.75 
 
 		 1116 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  30.1 
 
 		 1114 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  44.44 
 
 		 1223 aa  172  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  24.07 
 
 		 1085 aa  161  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  27.03 
 
 		 1032 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  24.11 
 
 		 1029 aa  140  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  24.36 
 
 		 1227 aa  128  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.41 
 
 		 1018 aa  127  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  30.37 
 
 		 810 aa  119  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  29.1 
 
 		 1018 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  27.6 
 
 		 904 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  29.96 
 
 		 910 aa  115  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  36.51 
 
 		 1039 aa  115  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  24.24 
 
 		 1018 aa  115  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  24.24 
 
 		 1018 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  33.68 
 
 		 1291 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  22.73 
 
 		 1211 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  24.08 
 
 		 1230 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  32.84 
 
 		 961 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  33.51 
 
 		 1099 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  25.72 
 
 		 1244 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  29.78 
 
 		 1018 aa  112  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  24.84 
 
 		 1018 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  30.12 
 
 		 1020 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  32.58 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  33.8 
 
 		 1103 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  33.78 
 
 		 1265 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  33.18 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  35.42 
 
 		 995 aa  110  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  24.92 
 
 		 1088 aa  110  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  25.24 
 
 		 1091 aa  108  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  27.65 
 
 		 1226 aa  108  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32.99 
 
 		 1020 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  34.22 
 
 		 1006 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  30.99 
 
 		 1017 aa  107  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.52 
 
 		 1013 aa  106  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  33.68 
 
 		 1018 aa  106  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  25.37 
 
 		 1018 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  34.57 
 
 		 1018 aa  105  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32.11 
 
 		 1018 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32.11 
 
 		 1018 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  27.58 
 
 		 1011 aa  104  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  26.91 
 
 		 906 aa  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  27.38 
 
 		 1308 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32.11 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  23.78 
 
 		 1223 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.81 
 
 		 1024 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  34.39 
 
 		 851 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  31.65 
 
 		 1029 aa  102  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  30.08 
 
 		 1155 aa  102  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.75 
 
 		 1009 aa  101  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  33.33 
 
 		 1020 aa  101  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.13 
 
 		 1059 aa  100  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  26.48 
 
 		 824 aa  99.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  30.14 
 
 		 1025 aa  99.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  31.96 
 
 		 1046 aa  99.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  32.81 
 
 		 1029 aa  99  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  32.81 
 
 		 1029 aa  99  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  34.94 
 
 		 881 aa  99  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  32.8 
 
 		 1029 aa  98.6  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  32.8 
 
 		 1029 aa  98.2  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  31.72 
 
 		 1009 aa  96.3  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  30.58 
 
 		 1022 aa  95.9  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  28.04 
 
 		 953 aa  95.1  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  30.48 
 
 		 962 aa  95.1  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  38.6 
 
 		 1346 aa  94.7  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  28.26 
 
 		 1182 aa  94  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  37.72 
 
 		 1234 aa  94  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 1029 aa  93.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  29.32 
 
 		 986 aa  93.2  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  41.01 
 
 		 1046 aa  92.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 		 1091 aa  92.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  23.21 
 
 		 1137 aa  91.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  33.87 
 
 		 1249 aa  91.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  30.69 
 
 		 989 aa  91.3  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  30.22 
 
 		 1165 aa  91.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  45.13 
 
 		 1009 aa  91.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  45.13 
 
 		 1009 aa  91.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  26.97 
 
 		 1048 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.04 
 
 		 1030 aa  90.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  28.09 
 
 		 1307 aa  90.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  38.57 
 
 		 1219 aa  90.1  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 		 1144 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  41.07 
 
 		 815 aa  90.1  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  29.51 
 
 		 1081 aa  89.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  28.21 
 
 		 1227 aa  89.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  28.33 
 
 		 1046 aa  89.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  29.78 
 
 		 1047 aa  89  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  29.78 
 
 		 1048 aa  89  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>