196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1158 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  37.87 
 
 		 1223 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  100 
 
 		 1226 aa  2475    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  35.83 
 
 		 1223 aa  675    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  37.89 
 
 		 1230 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  36.83 
 
 		 1224 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  33.99 
 
 		 1219 aa  612  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  39.17 
 
 		 1091 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  37.46 
 
 		 1227 aa  400  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  28.43 
 
 		 1238 aa  393  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  36.46 
 
 		 1085 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  42.34 
 
 		 1091 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  39.81 
 
 		 1088 aa  387  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  44.3 
 
 		 1303 aa  288  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  41.01 
 
 		 1346 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  50.35 
 
 		 1307 aa  283  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  42.23 
 
 		 1048 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  41.18 
 
 		 1046 aa  257  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  42.23 
 
 		 1047 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  42.23 
 
 		 1047 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  30.63 
 
 		 1232 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  42.23 
 
 		 1048 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  42.23 
 
 		 1047 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  42.23 
 
 		 1047 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  42.23 
 
 		 1047 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  31.55 
 
 		 1226 aa  257  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  41.18 
 
 		 1046 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  41.18 
 
 		 1046 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  41.18 
 
 		 1046 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  41.18 
 
 		 1046 aa  256  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  41.89 
 
 		 1047 aa  256  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  44.63 
 
 		 1083 aa  255  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  41.55 
 
 		 1048 aa  253  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  40.86 
 
 		 1232 aa  251  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  42.62 
 
 		 1164 aa  249  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  41.31 
 
 		 1144 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  49.6 
 
 		 1137 aa  246  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  40.78 
 
 		 1227 aa  244  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  40.46 
 
 		 1227 aa  244  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  41.14 
 
 		 1042 aa  241  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  49.54 
 
 		 1265 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  34.12 
 
 		 1308 aa  236  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  29.47 
 
 		 1211 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  39.93 
 
 		 1234 aa  185  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  29.26 
 
 		 1211 aa  183  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  33.18 
 
 		 1227 aa  177  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  30.38 
 
 		 1155 aa  174  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  38.05 
 
 		 1227 aa  172  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  39.68 
 
 		 1248 aa  170  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  36.96 
 
 		 1280 aa  169  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  46.24 
 
 		 1101 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  37.88 
 
 		 1248 aa  164  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 		 1248 aa  163  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  36.14 
 
 		 1229 aa  158  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  46.23 
 
 		 1220 aa  157  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  46.23 
 
 		 1229 aa  157  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  40.29 
 
 		 1214 aa  155  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  39.93 
 
 		 1165 aa  155  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  45.68 
 
 		 1214 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  36.05 
 
 		 1213 aa  152  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  39.73 
 
 		 1214 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  38.36 
 
 		 1214 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  44.85 
 
 		 1214 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  44.85 
 
 		 1214 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  49.4 
 
 		 1244 aa  140  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  45.18 
 
 		 1247 aa  137  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  47.85 
 
 		 1182 aa  137  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  44.5 
 
 		 1245 aa  134  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  34.91 
 
 		 1245 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  36.49 
 
 		 1247 aa  125  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  35.09 
 
 		 1081 aa  114  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  30.54 
 
 		 1020 aa  112  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  25.99 
 
 		 1039 aa  111  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.05 
 
 		 1030 aa  110  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  42.07 
 
 		 1025 aa  110  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  32.18 
 
 		 1047 aa  110  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  31.85 
 
 		 1013 aa  110  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  31.47 
 
 		 1022 aa  110  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  37.42 
 
 		 953 aa  107  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  31.19 
 
 		 1018 aa  105  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  39.88 
 
 		 995 aa  105  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  29.53 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  40.26 
 
 		 1009 aa  103  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  40.26 
 
 		 1009 aa  103  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  31 
 
 		 1172 aa  103  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.31 
 
 		 1291 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  33.17 
 
 		 1018 aa  103  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.28 
 
 		 1108 aa  102  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  29.51 
 
 		 1029 aa  102  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  29.86 
 
 		 1029 aa  102  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  29.51 
 
 		 1029 aa  102  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  29.86 
 
 		 1029 aa  102  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.58 
 
 		 881 aa  102  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  30.29 
 
 		 1020 aa  101  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  30.21 
 
 		 1029 aa  101  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  40.67 
 
 		 1009 aa  101  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 		 1018 aa  101  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1018 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  30.59 
 
 		 1018 aa  100  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32.5 
 
 		 1018 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  42.48 
 
 		 1018 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>