163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0467 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  88.93 
 
 		 1247 aa  1105    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  89.99 
 
 		 1245 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1245 aa  2234    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  30.37 
 
 		 1244 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  29.97 
 
 		 1214 aa  364  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  32.45 
 
 		 1213 aa  223  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  41.05 
 
 		 1211 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  41.46 
 
 		 1211 aa  220  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.87 
 
 		 1219 aa  211  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  26.82 
 
 		 1182 aa  210  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  32.24 
 
 		 1230 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  36.01 
 
 		 1085 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  40.41 
 
 		 1101 aa  194  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  48.56 
 
 		 1214 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  39.74 
 
 		 1214 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  41.95 
 
 		 1214 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  40.73 
 
 		 1214 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  32.35 
 
 		 1091 aa  186  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  40.78 
 
 		 1214 aa  184  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  29.25 
 
 		 1088 aa  180  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  31.1 
 
 		 1091 aa  176  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  45.32 
 
 		 1224 aa  174  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  47.7 
 
 		 1223 aa  172  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  38.52 
 
 		 1144 aa  171  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  44.6 
 
 		 1223 aa  171  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  53.57 
 
 		 1234 aa  169  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  28.81 
 
 		 1346 aa  166  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  52.91 
 
 		 1280 aa  165  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  43.62 
 
 		 1226 aa  164  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  38.65 
 
 		 1226 aa  162  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  35.98 
 
 		 1265 aa  162  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  35.06 
 
 		 1232 aa  162  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  34.83 
 
 		 1155 aa  159  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  35.27 
 
 		 1238 aa  158  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  35.45 
 
 		 1229 aa  158  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  35.45 
 
 		 1220 aa  158  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  35.45 
 
 		 1229 aa  158  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  43.48 
 
 		 1307 aa  157  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  43.48 
 
 		 1303 aa  157  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  36 
 
 		 1227 aa  157  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  30.68 
 
 		 1227 aa  157  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  32.37 
 
 		 1227 aa  156  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  33.04 
 
 		 1048 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  33.82 
 
 		 1227 aa  155  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  46.18 
 
 		 1248 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  45.85 
 
 		 1248 aa  155  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  33.04 
 
 		 1048 aa  154  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1048 aa  154  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  33.04 
 
 		 1047 aa  154  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  33.04 
 
 		 1047 aa  154  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  34.46 
 
 		 1083 aa  154  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  33.04 
 
 		 1047 aa  154  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  33.24 
 
 		 1047 aa  154  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  33.04 
 
 		 1047 aa  153  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  40.98 
 
 		 1164 aa  153  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  33.04 
 
 		 1047 aa  153  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  34.94 
 
 		 1227 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  28.94 
 
 		 1247 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  52.57 
 
 		 1248 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  32.05 
 
 		 1046 aa  145  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  33.45 
 
 		 1046 aa  145  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  33.45 
 
 		 1046 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  33.45 
 
 		 1046 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  32.21 
 
 		 1308 aa  143  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  33.45 
 
 		 1046 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  46.15 
 
 		 1137 aa  140  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  36.59 
 
 		 1042 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  52.69 
 
 		 1165 aa  128  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  43.41 
 
 		 1232 aa  121  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  33.47 
 
 		 1009 aa  102  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  33.47 
 
 		 1009 aa  102  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  39.39 
 
 		 953 aa  102  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  41.57 
 
 		 1022 aa  101  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  38.89 
 
 		 1020 aa  101  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.78 
 
 		 881 aa  100  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  44.03 
 
 		 1018 aa  100  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  41.56 
 
 		 1047 aa  99  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  46.36 
 
 		 1025 aa  99  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  43.17 
 
 		 1009 aa  96.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  40.91 
 
 		 1018 aa  96.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  39.87 
 
 		 1081 aa  96.3  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  40.91 
 
 		 1018 aa  95.9  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  40.91 
 
 		 1018 aa  95.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  40.3 
 
 		 1018 aa  95.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  40.91 
 
 		 1018 aa  95.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  43.75 
 
 		 1020 aa  95.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  40.91 
 
 		 1018 aa  94.7  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  41.04 
 
 		 1018 aa  94  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  41.04 
 
 		 1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  41.04 
 
 		 1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  39.88 
 
 		 995 aa  94.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  45.06 
 
 		 1017 aa  93.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  37.2 
 
 		 1046 aa  93.6  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  42.54 
 
 		 1018 aa  93.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  40.3 
 
 		 1018 aa  94  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  30.62 
 
 		 1165 aa  93.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  37.99 
 
 		 1020 aa  92.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  41.04 
 
 		 1018 aa  91.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  51.58 
 
 		 1291 aa  91.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  48.45 
 
 		 1030 aa  90.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>