231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3289 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  45.22 
 
 		 1048 aa  763    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  45.2 
 
 		 1048 aa  754    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  45.22 
 
 		 1048 aa  763    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  48.91 
 
 		 1227 aa  931    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  45.13 
 
 		 1047 aa  762    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  39.27 
 
 		 1265 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  45.23 
 
 		 1047 aa  768    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  39.58 
 
 		 1232 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  44.17 
 
 		 1047 aa  777    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  41.41 
 
 		 1232 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  41.19 
 
 		 1137 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  98.7 
 
 		 1229 aa  1985    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  98.37 
 
 		 1229 aa  1976    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  47.58 
 
 		 1227 aa  910    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  43.66 
 
 		 1042 aa  732    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  51.17 
 
 		 1227 aa  952    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  42.85 
 
 		 1144 aa  680    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  45.13 
 
 		 1047 aa  764    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  39.68 
 
 		 1226 aa  679    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  37.69 
 
 		 1238 aa  651    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  49.88 
 
 		 1227 aa  942    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  45.3 
 
 		 1047 aa  770    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  100 
 
 		 1220 aa  2386    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  45.13 
 
 		 1047 aa  764    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  73.07 
 
 		 1083 aa  496  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  30.53 
 
 		 1226 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  31.73 
 
 		 1223 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  33.02 
 
 		 1223 aa  439  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  30.38 
 
 		 1224 aa  435  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  31.5 
 
 		 1227 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  45.12 
 
 		 1046 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  45.27 
 
 		 1046 aa  413  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  45.12 
 
 		 1046 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  45.12 
 
 		 1046 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  44.97 
 
 		 1046 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  32.29 
 
 		 1213 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  38.62 
 
 		 1165 aa  396  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  32.73 
 
 		 1214 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  32.79 
 
 		 1214 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  33.26 
 
 		 1214 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  31.26 
 
 		 1244 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  57.19 
 
 		 1164 aa  338  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  37.49 
 
 		 1155 aa  326  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  31.72 
 
 		 1088 aa  281  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  35.83 
 
 		 1091 aa  275  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  34.05 
 
 		 1091 aa  273  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  33.87 
 
 		 1346 aa  271  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  47.68 
 
 		 1308 aa  270  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  45.8 
 
 		 1234 aa  268  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  35.44 
 
 		 1247 aa  263  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  33.7 
 
 		 1303 aa  249  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  33.75 
 
 		 1307 aa  245  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  35.18 
 
 		 1085 aa  231  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  28.11 
 
 		 1219 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  34.07 
 
 		 1214 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  44.91 
 
 		 1211 aa  196  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  32.79 
 
 		 1214 aa  196  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  38.24 
 
 		 1230 aa  195  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  43.93 
 
 		 1214 aa  191  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  42.26 
 
 		 1211 aa  191  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  35.5 
 
 		 1248 aa  172  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  41.03 
 
 		 1248 aa  168  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  45.74 
 
 		 1101 aa  162  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  52.87 
 
 		 1248 aa  161  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  55.56 
 
 		 1182 aa  155  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  28.74 
 
 		 1280 aa  152  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  37.45 
 
 		 1245 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  40.49 
 
 		 1245 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  40 
 
 		 1247 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  32.77 
 
 		 1018 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  34.9 
 
 		 1018 aa  123  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.64 
 
 		 1291 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  29.57 
 
 		 1029 aa  121  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  33.42 
 
 		 1018 aa  121  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  35.65 
 
 		 1009 aa  120  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  38.42 
 
 		 953 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  46.43 
 
 		 881 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.51 
 
 		 1018 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.75 
 
 		 1029 aa  118  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  29.68 
 
 		 1029 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 906 aa  116  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  28.21 
 
 		 1018 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  30.7 
 
 		 1018 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.44 
 
 		 1029 aa  115  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  30.7 
 
 		 1018 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  30.7 
 
 		 1018 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  28.28 
 
 		 1018 aa  115  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  33.65 
 
 		 1018 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  29.09 
 
 		 1029 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  29.11 
 
 		 1029 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  28.44 
 
 		 1029 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  28.13 
 
 		 1029 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  28.13 
 
 		 1029 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  48.78 
 
 		 1025 aa  113  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  45.6 
 
 		 910 aa  113  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  27.29 
 
 		 1020 aa  113  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  27.95 
 
 		 1029 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  46.46 
 
 		 1013 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.66 
 
 		 1029 aa  112  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  44.14 
 
 		 995 aa  111  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>