198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1640 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  62.97 
 
 		 1018 aa  1125    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  99.8 
 
 		 1018 aa  2023    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  54.36 
 
 		 1018 aa  951    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  62.57 
 
 		 1018 aa  1098    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  62.38 
 
 		 1018 aa  1132    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  62.77 
 
 		 1018 aa  1100    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  46.92 
 
 		 1020 aa  771    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  97.35 
 
 		 1018 aa  1857    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  51.22 
 
 		 1018 aa  877    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  90.57 
 
 		 1018 aa  1659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1018 aa  2027    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  53.38 
 
 		 1018 aa  948    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  56.61 
 
 		 1018 aa  1007    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  99.9 
 
 		 1018 aa  2024    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  39.5 
 
 		 1018 aa  595  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  38.94 
 
 		 1013 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  37.96 
 
 		 1018 aa  555  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  34.3 
 
 		 1020 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  33.99 
 
 		 1020 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  29.29 
 
 		 1029 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.3 
 
 		 1049 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.65 
 
 		 1029 aa  379  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  28.42 
 
 		 1039 aa  379  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.49 
 
 		 1029 aa  376  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.16 
 
 		 1029 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.88 
 
 		 1029 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  28.15 
 
 		 1029 aa  361  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  28.15 
 
 		 1029 aa  361  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.05 
 
 		 1029 aa  360  7e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  28.06 
 
 		 1029 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  27.7 
 
 		 1029 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.05 
 
 		 1029 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  28.58 
 
 		 989 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.29 
 
 		 1024 aa  276  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.51 
 
 		 1059 aa  270  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  26.1 
 
 		 1046 aa  267  8.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  25.21 
 
 		 1011 aa  245  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  24.96 
 
 		 1085 aa  201  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  26.64 
 
 		 906 aa  197  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  43.34 
 
 		 1017 aa  196  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  27.57 
 
 		 1048 aa  195  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1048 aa  195  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  30.71 
 
 		 1038 aa  195  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  52.97 
 
 		 953 aa  194  8e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  27.39 
 
 		 1048 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.92 
 
 		 1030 aa  191  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  41.36 
 
 		 1081 aa  183  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  29.77 
 
 		 1033 aa  179  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.75 
 
 		 1009 aa  177  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  34.2 
 
 		 1009 aa  176  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  34.2 
 
 		 1009 aa  176  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  22.23 
 
 		 961 aa  175  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  50.25 
 
 		 1006 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.43 
 
 		 1108 aa  163  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  36.21 
 
 		 881 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  48.19 
 
 		 1025 aa  157  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.16 
 
 		 904 aa  155  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  34.57 
 
 		 995 aa  155  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  42.11 
 
 		 1022 aa  154  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  40.81 
 
 		 986 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  48.28 
 
 		 986 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  37.06 
 
 		 1046 aa  151  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  36.82 
 
 		 1047 aa  151  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  39.09 
 
 		 1291 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  39.79 
 
 		 962 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  37.22 
 
 		 1023 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  45.2 
 
 		 995 aa  144  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  37.92 
 
 		 1058 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  42.78 
 
 		 1009 aa  135  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  26.76 
 
 		 1114 aa  135  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  28.17 
 
 		 1116 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  37.06 
 
 		 1249 aa  128  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  43.04 
 
 		 1191 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  39.23 
 
 		 1346 aa  120  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  32.59 
 
 		 1223 aa  119  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  31.76 
 
 		 1219 aa  118  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  37.37 
 
 		 1165 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  24.03 
 
 		 1091 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  33.64 
 
 		 1224 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  30.59 
 
 		 1230 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  34.1 
 
 		 1047 aa  110  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  34.83 
 
 		 810 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  35.56 
 
 		 1211 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  35.34 
 
 		 1214 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  35.56 
 
 		 1211 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  34.09 
 
 		 1047 aa  108  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  34.2 
 
 		 1047 aa  108  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  34.2 
 
 		 1047 aa  108  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  34.2 
 
 		 1047 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  34.2 
 
 		 1047 aa  108  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  36.99 
 
 		 1234 aa  108  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  34.09 
 
 		 1164 aa  108  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  36.84 
 
 		 1214 aa  108  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  36.98 
 
 		 1303 aa  108  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  35.96 
 
 		 1229 aa  107  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  35.96 
 
 		 1229 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  29.91 
 
 		 1223 aa  107  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  39.31 
 
 		 1101 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  36.99 
 
 		 1226 aa  107  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  35.96 
 
 		 1220 aa  107  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>