253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1915 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  100 
 
 
815 aa  1582    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  43.25 
 
 
824 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  43.01 
 
 
824 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  39.73 
 
 
810 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  47.51 
 
 
1099 aa  219  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  51.94 
 
 
1103 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  44.92 
 
 
910 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  42 
 
 
906 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  34.95 
 
 
1018 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  30.74 
 
 
904 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  40.49 
 
 
1009 aa  114  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.22 
 
 
961 aa  114  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  35.75 
 
 
1018 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  35.15 
 
 
1018 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  33.8 
 
 
1018 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  34.26 
 
 
1018 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  33.8 
 
 
1018 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  36.32 
 
 
1018 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.78 
 
 
859 aa  111  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  35.19 
 
 
1020 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  37.69 
 
 
1291 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.23 
 
 
1020 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  33.02 
 
 
1018 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  33.02 
 
 
1018 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  29.48 
 
 
1308 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  34.72 
 
 
1018 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  25.58 
 
 
1009 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  33.02 
 
 
1018 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  33.02 
 
 
1018 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  25.58 
 
 
1009 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  33.8 
 
 
1018 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  34.15 
 
 
1020 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.28 
 
 
1030 aa  107  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  37.16 
 
 
1219 aa  107  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  33.82 
 
 
1029 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  31.12 
 
 
1018 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  34.97 
 
 
1017 aa  106  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  35.29 
 
 
1180 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  35.81 
 
 
1137 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  34.17 
 
 
1013 aa  104  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  37.58 
 
 
1029 aa  104  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  37.58 
 
 
1029 aa  104  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  32.98 
 
 
851 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  36.89 
 
 
1144 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  30.34 
 
 
1227 aa  103  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  36.94 
 
 
1029 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  39.07 
 
 
1346 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  37.18 
 
 
1029 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  36.94 
 
 
1029 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  36.94 
 
 
1029 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  36.94 
 
 
1029 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.8 
 
 
1116 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  36.94 
 
 
1029 aa  102  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  36.94 
 
 
1029 aa  102  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  32.67 
 
 
1018 aa  102  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  33.77 
 
 
1025 aa  102  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  36.94 
 
 
1029 aa  102  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  30.97 
 
 
1019 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  28.43 
 
 
953 aa  101  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  40.91 
 
 
1230 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  38.42 
 
 
1224 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  30.49 
 
 
1232 aa  100  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  38.27 
 
 
1091 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  40 
 
 
1234 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  33.94 
 
 
1164 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  38.93 
 
 
1307 aa  99  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  32.21 
 
 
1303 aa  99  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  34.17 
 
 
1023 aa  99  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  41.1 
 
 
1223 aa  99  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  37.18 
 
 
1088 aa  98.6  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  45.16 
 
 
995 aa  98.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  34.2 
 
 
1223 aa  98.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  28.86 
 
 
1039 aa  98.6  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  36.02 
 
 
1091 aa  98.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  36.65 
 
 
1081 aa  98.2  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  30.71 
 
 
1227 aa  98.2  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  38.8 
 
 
1223 aa  98.2  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  33.67 
 
 
1265 aa  98.2  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  29.46 
 
 
1232 aa  98.2  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  34.85 
 
 
1024 aa  97.8  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  35.68 
 
 
881 aa  97.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  34.17 
 
 
1238 aa  97.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  30 
 
 
1213 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  37.99 
 
 
1249 aa  96.3  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  34.3 
 
 
1048 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  34.3 
 
 
1048 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  34.3 
 
 
1047 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  34.3 
 
 
1047 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  31.13 
 
 
1214 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  34.3 
 
 
1048 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  34.3 
 
 
1047 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  32.03 
 
 
1214 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  34.3 
 
 
1047 aa  95.9  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  34.3 
 
 
1047 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  37.85 
 
 
989 aa  95.1  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  39.51 
 
 
1047 aa  95.5  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  36.02 
 
 
1108 aa  95.1  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  35 
 
 
1009 aa  95.1  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  31.02 
 
 
1155 aa  95.1  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  33.82 
 
 
1047 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>