208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2167 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  88.92 
 
 
1029 aa  1870    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  89.12 
 
 
1029 aa  1846    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  89.02 
 
 
1029 aa  1844    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  89.41 
 
 
1029 aa  1852    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  88.63 
 
 
1029 aa  1867    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  89.12 
 
 
1029 aa  1846    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  88.82 
 
 
1029 aa  1863    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  89.21 
 
 
1029 aa  1850    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  89.02 
 
 
1029 aa  1872    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  100 
 
 
1029 aa  2094    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  75.32 
 
 
1029 aa  1570    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  31.89 
 
 
1049 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.27 
 
 
1018 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  31.31 
 
 
1018 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  30.14 
 
 
1018 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  28.08 
 
 
1018 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  30.38 
 
 
1020 aa  365  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  28.68 
 
 
1018 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  27.88 
 
 
1018 aa  361  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  28.46 
 
 
1018 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  28.15 
 
 
1018 aa  354  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  29.48 
 
 
1013 aa  353  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  28.2 
 
 
1018 aa  347  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  28.2 
 
 
1018 aa  347  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  28.2 
 
 
1018 aa  347  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  28.29 
 
 
1018 aa  345  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.91 
 
 
1009 aa  326  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.75 
 
 
1038 aa  303  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  26.09 
 
 
1020 aa  300  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.74 
 
 
1059 aa  272  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  26.57 
 
 
1024 aa  268  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  26.34 
 
 
1046 aa  259  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  26.64 
 
 
1011 aa  249  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  30.93 
 
 
1020 aa  231  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  36.43 
 
 
1018 aa  189  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  36.93 
 
 
1039 aa  181  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  35.36 
 
 
1018 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  32.7 
 
 
1018 aa  180  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  25.94 
 
 
953 aa  179  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  37.5 
 
 
1009 aa  179  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  37.5 
 
 
1009 aa  179  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  42.74 
 
 
1081 aa  172  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  49.08 
 
 
1025 aa  169  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  43.02 
 
 
1291 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  40.76 
 
 
1047 aa  151  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  48.77 
 
 
1023 aa  149  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  34.24 
 
 
995 aa  149  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  43.65 
 
 
1006 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  32.38 
 
 
986 aa  146  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  43.6 
 
 
1046 aa  145  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  44.57 
 
 
1017 aa  144  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.34 
 
 
881 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  44.32 
 
 
986 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  23.53 
 
 
1029 aa  139  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  41.31 
 
 
1249 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  40.39 
 
 
1191 aa  133  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  35.35 
 
 
962 aa  132  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  36.03 
 
 
989 aa  128  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25.93 
 
 
1114 aa  127  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  44.3 
 
 
995 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  40.91 
 
 
1058 aa  125  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  42.86 
 
 
1022 aa  125  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.5 
 
 
906 aa  124  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  30.88 
 
 
1033 aa  122  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  36.22 
 
 
1030 aa  121  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  29.3 
 
 
1214 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  32.79 
 
 
1214 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  42.86 
 
 
1101 aa  115  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  28.31 
 
 
1213 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  32.78 
 
 
1214 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  46.58 
 
 
1214 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  39.06 
 
 
1214 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  30.67 
 
 
1223 aa  112  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  33.2 
 
 
1211 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  45.21 
 
 
1214 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  31.25 
 
 
1009 aa  111  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  35.09 
 
 
1211 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  31.39 
 
 
910 aa  109  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  32.34 
 
 
961 aa  108  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  29.06 
 
 
1230 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  37.95 
 
 
1346 aa  107  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  41.33 
 
 
1238 aa  104  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  29.24 
 
 
1091 aa  104  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  40.82 
 
 
1091 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  23.97 
 
 
1088 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  31.75 
 
 
1116 aa  103  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  26.8 
 
 
1303 aa  103  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  40.82 
 
 
1307 aa  101  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  38.46 
 
 
1226 aa  99.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  33.66 
 
 
1180 aa  98.6  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  27.57 
 
 
1165 aa  98.2  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  30.45 
 
 
810 aa  97.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  34.84 
 
 
1226 aa  97.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  27.4 
 
 
1083 aa  97.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  29.28 
 
 
1224 aa  96.3  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  28.03 
 
 
1144 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  29.17 
 
 
1103 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  24.02 
 
 
904 aa  95.1  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  36.81 
 
 
1232 aa  94.7  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  33.7 
 
 
1108 aa  94.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>