255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3777 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1103 aa  2015    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  42.52 
 
 		 1099 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  44.53 
 
 		 824 aa  222  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  48.23 
 
 		 824 aa  220  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  43.32 
 
 		 810 aa  204  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  41.8 
 
 		 815 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  40.27 
 
 		 910 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  30.71 
 
 		 1172 aa  131  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  34.25 
 
 		 1172 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  37.97 
 
 		 1180 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.47 
 
 		 906 aa  128  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  33.73 
 
 		 1165 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  37.93 
 
 		 1116 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  32.52 
 
 		 961 aa  122  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  38.94 
 
 		 1223 aa  117  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.85 
 
 		 1108 aa  116  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  36.25 
 
 		 1020 aa  114  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  32.06 
 
 		 1029 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  24.02 
 
 		 1029 aa  112  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  23.38 
 
 		 1029 aa  112  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  23.53 
 
 		 1029 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  23.71 
 
 		 1029 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  30.18 
 
 		 1059 aa  110  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  23.71 
 
 		 1029 aa  109  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  23.83 
 
 		 1029 aa  109  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  40.52 
 
 		 1009 aa  108  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  23.54 
 
 		 1029 aa  108  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  23.54 
 
 		 1029 aa  108  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  37.56 
 
 		 1024 aa  106  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  29.41 
 
 		 1029 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.41 
 
 		 1029 aa  105  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  32.16 
 
 		 1030 aa  105  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  33.65 
 
 		 851 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  27.24 
 
 		 1018 aa  105  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  31.37 
 
 		 904 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  37.19 
 
 		 1020 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  43.36 
 
 		 1101 aa  102  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  37.88 
 
 		 1006 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  37.66 
 
 		 1009 aa  102  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  37.66 
 
 		 1009 aa  102  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  36.16 
 
 		 1303 aa  101  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  37.91 
 
 		 1211 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  37.91 
 
 		 1211 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  27.97 
 
 		 1018 aa  100  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  28.77 
 
 		 1085 aa  99.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  35 
 
 		 1022 aa  99.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  35.35 
 
 		 1020 aa  99.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  35.03 
 
 		 1307 aa  99  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  37.43 
 
 		 1227 aa  98.6  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  33.5 
 
 		 953 aa  98.2  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  41.46 
 
 		 986 aa  98.2  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  20.66 
 
 		 1039 aa  98.2  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  32.33 
 
 		 1019 aa  97.8  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  30.88 
 
 		 1018 aa  97.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  35.19 
 
 		 1227 aa  97.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  29.14 
 
 		 1018 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  35.71 
 
 		 1291 aa  97.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  41.25 
 
 		 881 aa  97.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  29.49 
 
 		 1227 aa  96.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  38.3 
 
 		 986 aa  96.3  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  40.44 
 
 		 1018 aa  95.9  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  40.4 
 
 		 995 aa  95.9  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  32.26 
 
 		 1049 aa  95.5  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  35.61 
 
 		 995 aa  95.5  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  32.11 
 
 		 1013 aa  95.5  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  28.31 
 
 		 1223 aa  95.1  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  40.44 
 
 		 1346 aa  95.1  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  27.29 
 
 		 1018 aa  95.1  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  34.26 
 
 		 1017 aa  94.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  39.71 
 
 		 1018 aa  94.7  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  36.55 
 
 		 1214 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  39.39 
 
 		 962 aa  94.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  39.71 
 
 		 1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  37.34 
 
 		 1038 aa  94.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.36 
 
 		 1219 aa  94.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  39.71 
 
 		 1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  29.22 
 
 		 1230 aa  94  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  39.71 
 
 		 1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  40.11 
 
 		 1144 aa  94  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  37.37 
 
 		 1083 aa  92.8  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  31.48 
 
 		 1238 aa  93.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  37.16 
 
 		 1226 aa  92  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  40.3 
 
 		 1018 aa  92.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  29.53 
 
 		 1033 aa  92  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  38.97 
 
 		 1018 aa  91.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  39.2 
 
 		 1137 aa  91.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  46.15 
 
 		 1091 aa  91.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  37.82 
 
 		 1025 aa  91.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  42.31 
 
 		 1229 aa  91.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  42.31 
 
 		 1229 aa  91.3  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  45.33 
 
 		 1164 aa  91.3  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  42.31 
 
 		 1220 aa  91.7  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  30.49 
 
 		 1018 aa  90.9  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  38.81 
 
 		 1223 aa  90.9  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  40.3 
 
 		 1018 aa  90.9  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  32.59 
 
 		 1165 aa  90.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  33.33 
 
 		 1265 aa  90.1  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 1232 aa  90.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  37.5 
 
 		 1114 aa  89.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  35.9 
 
 		 1009 aa  89.7  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>