185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1031 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1033 aa  2094    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  28.84 
 
 		 1049 aa  328  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  29.63 
 
 		 1018 aa  318  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  28.2 
 
 		 1039 aa  318  4e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  28.1 
 
 		 1018 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  28.95 
 
 		 1046 aa  305  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.1 
 
 		 1059 aa  296  9e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  24.98 
 
 		 1029 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  26.23 
 
 		 1009 aa  271  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.07 
 
 		 1029 aa  266  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  24.77 
 
 		 1029 aa  248  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  34.83 
 
 		 1018 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  32.47 
 
 		 1018 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  28.69 
 
 		 1018 aa  201  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  30.89 
 
 		 1018 aa  200  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  30.56 
 
 		 1018 aa  196  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  30.85 
 
 		 1018 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.82 
 
 		 961 aa  182  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  27.24 
 
 		 1020 aa  177  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  33.08 
 
 		 1018 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  31.96 
 
 		 1018 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  31.96 
 
 		 1018 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  31.96 
 
 		 1018 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  40.6 
 
 		 1018 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.44 
 
 		 1108 aa  168  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  48.54 
 
 		 1020 aa  162  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  29.66 
 
 		 1013 aa  161  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.4 
 
 		 1038 aa  158  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  36.56 
 
 		 1030 aa  157  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  41.18 
 
 		 1009 aa  154  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  41.18 
 
 		 1009 aa  154  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  38.28 
 
 		 1018 aa  153  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.46 
 
 		 1029 aa  151  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  38.87 
 
 		 1018 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  40.62 
 
 		 953 aa  146  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  34.98 
 
 		 881 aa  141  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  41.04 
 
 		 1029 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  25.45 
 
 		 1024 aa  139  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  41.04 
 
 		 1029 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  31.07 
 
 		 1029 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  41.04 
 
 		 1029 aa  139  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  41.04 
 
 		 1029 aa  139  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  41.04 
 
 		 1029 aa  139  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  24.22 
 
 		 1091 aa  139  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  41.04 
 
 		 1029 aa  139  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  38.25 
 
 		 1081 aa  138  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  41.09 
 
 		 986 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  44.1 
 
 		 1025 aa  135  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  24.17 
 
 		 995 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  23.79 
 
 		 1032 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  29.7 
 
 		 1047 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  40.78 
 
 		 962 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  26.4 
 
 		 1011 aa  128  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  36.63 
 
 		 995 aa  127  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  44.24 
 
 		 1017 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  27.34 
 
 		 1020 aa  125  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  39.29 
 
 		 1249 aa  124  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  46.3 
 
 		 1023 aa  124  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  25.81 
 
 		 989 aa  122  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  37.7 
 
 		 1006 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  37.87 
 
 		 986 aa  119  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  26.55 
 
 		 1114 aa  119  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  40.12 
 
 		 1291 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  35.71 
 
 		 1046 aa  118  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  34.7 
 
 		 1022 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  40.68 
 
 		 1191 aa  108  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  39.36 
 
 		 1058 aa  107  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  34.22 
 
 		 1009 aa  105  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  33.19 
 
 		 1226 aa  102  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  42.24 
 
 		 1214 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  28.57 
 
 		 910 aa  101  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  41.06 
 
 		 1088 aa  101  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  50.44 
 
 		 1224 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  42.68 
 
 		 1214 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  34.27 
 
 		 1230 aa  100  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  47.79 
 
 		 1085 aa  100  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  40.91 
 
 		 1213 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  47.32 
 
 		 1219 aa  98.6  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  29.43 
 
 		 1223 aa  97.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  32.22 
 
 		 1211 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  30.16 
 
 		 1211 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  41.38 
 
 		 1346 aa  96.3  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  36.12 
 
 		 1214 aa  94.7  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  40.76 
 
 		 1214 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  48.15 
 
 		 1303 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  40.76 
 
 		 1214 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  40.76 
 
 		 1214 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  48.15 
 
 		 1307 aa  92.8  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  42.47 
 
 		 1101 aa  92.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  32.33 
 
 		 906 aa  90.9  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  26.12 
 
 		 810 aa  90.9  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  43.93 
 
 		 1234 aa  89.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  39.58 
 
 		 1223 aa  89.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  28.8 
 
 		 1103 aa  89  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  28.23 
 
 		 1165 aa  87.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  28.93 
 
 		 815 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  29.76 
 
 		 1227 aa  86.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  28.86 
 
 		 824 aa  85.9  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.37 
 
 		 1116 aa  84  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  23.47 
 
 		 852 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>