287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0283 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  100 
 
 		 1223 aa  2304    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  28.61 
 
 		 1108 aa  416  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  27.45 
 
 		 1172 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  27.11 
 
 		 1172 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  29.35 
 
 		 1165 aa  363  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  42.46 
 
 		 1116 aa  265  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  41.2 
 
 		 1114 aa  254  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  36.31 
 
 		 1180 aa  226  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  33.93 
 
 		 1032 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  34.68 
 
 		 1029 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  38.67 
 
 		 910 aa  136  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  35.65 
 
 		 1020 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  22.34 
 
 		 1039 aa  123  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 810 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  29.09 
 
 		 1018 aa  122  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  37.7 
 
 		 824 aa  121  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 824 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  25.46 
 
 		 1029 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  34.57 
 
 		 906 aa  116  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  32.36 
 
 		 904 aa  115  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  25.25 
 
 		 1029 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  33.81 
 
 		 1024 aa  114  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  34.33 
 
 		 1025 aa  114  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  28.09 
 
 		 1018 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  36.92 
 
 		 1020 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  31.17 
 
 		 1011 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  28.51 
 
 		 1018 aa  112  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  24.48 
 
 		 1029 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.97 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  33.2 
 
 		 1018 aa  111  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  32.41 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  24.39 
 
 		 1029 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  29.64 
 
 		 989 aa  108  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  36.45 
 
 		 1291 aa  109  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  32.18 
 
 		 1046 aa  108  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  31.88 
 
 		 1099 aa  108  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  41.97 
 
 		 1103 aa  108  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  34.78 
 
 		 851 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  35.94 
 
 		 1226 aa  107  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  24.35 
 
 		 1247 aa  107  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  36.82 
 
 		 1046 aa  107  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  35.29 
 
 		 1022 aa  106  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  34.73 
 
 		 1020 aa  106  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  31.83 
 
 		 1046 aa  106  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  31.83 
 
 		 1046 aa  106  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  32.34 
 
 		 1013 aa  105  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  31.83 
 
 		 1046 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  31.22 
 
 		 1029 aa  105  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  35.08 
 
 		 815 aa  105  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  30.69 
 
 		 1029 aa  105  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  33.9 
 
 		 1047 aa  105  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  30.69 
 
 		 1029 aa  105  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  30.37 
 
 		 1155 aa  105  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  28.75 
 
 		 1018 aa  105  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  30.69 
 
 		 1029 aa  105  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  33.68 
 
 		 1018 aa  104  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  30.69 
 
 		 1029 aa  105  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  25.84 
 
 		 1018 aa  104  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  30.69 
 
 		 1029 aa  104  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  30.69 
 
 		 1029 aa  104  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  28.75 
 
 		 1018 aa  104  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.06 
 
 		 1030 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  31.49 
 
 		 1046 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  27.42 
 
 		 1091 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  35.38 
 
 		 986 aa  104  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  34.9 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  25.16 
 
 		 1088 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  33.16 
 
 		 1018 aa  103  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  31.88 
 
 		 995 aa  102  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  33.16 
 
 		 1018 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  31.92 
 
 		 1101 aa  102  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  33.16 
 
 		 1018 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  36.55 
 
 		 1006 aa  102  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  35.29 
 
 		 1009 aa  102  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  26.68 
 
 		 1244 aa  101  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  32.63 
 
 		 1018 aa  100  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  24.29 
 
 		 1223 aa  99.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  26.44 
 
 		 1091 aa  99.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  33.9 
 
 		 881 aa  99.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  35.38 
 
 		 962 aa  99  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  34.39 
 
 		 1232 aa  99  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  32.13 
 
 		 1227 aa  99  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  34.43 
 
 		 953 aa  98.6  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  33.8 
 
 		 1165 aa  98.2  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.38 
 
 		 1059 aa  98.2  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  31.98 
 
 		 961 aa  97.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  31.82 
 
 		 1137 aa  97.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  25.43 
 
 		 1085 aa  97.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  34.69 
 
 		 1017 aa  96.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  31.75 
 
 		 1047 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  35.5 
 
 		 1083 aa  95.5  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  35 
 
 		 1023 aa  95.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  31.39 
 
 		 1047 aa  95.1  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  31.39 
 
 		 1047 aa  95.1  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  31.39 
 
 		 1047 aa  95.1  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  31.39 
 
 		 1048 aa  95.1  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  31.39 
 
 		 1047 aa  95.1  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1048 aa  95.1  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  25.14 
 
 		 1049 aa  94.7  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  31.02 
 
 		 1047 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>