56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1376 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1335    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  24.3 
 
 		 693 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  24.3 
 
 		 693 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  25 
 
 		 690 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  25.15 
 
 		 690 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  26 
 
 		 642 aa  130  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  24.04 
 
 		 699 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  23.74 
 
 		 677 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  24.35 
 
 		 671 aa  99  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  23.4 
 
 		 660 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  28.23 
 
 		 427 aa  91.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  22.07 
 
 		 666 aa  90.9  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  22.32 
 
 		 672 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  23.47 
 
 		 676 aa  82  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  22.22 
 
 		 658 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  26.19 
 
 		 686 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  42.59 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  21.31 
 
 		 671 aa  77.4  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  27.86 
 
 		 660 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  29.41 
 
 		 657 aa  67  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  35.82 
 
 		 662 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  22.74 
 
 		 663 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  24.31 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  24.07 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  32 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  32.85 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  31.67 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  31.87 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  32.26 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  30.08 
 
 		 683 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4565  hypothetical protein  21.39 
 
 		 665 aa  57.4  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  31.53 
 
 		 660 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  23.95 
 
 		 260 aa  53.9  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  32.09 
 
 		 700 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  27.02 
 
 		 978 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  24.43 
 
 		 704 aa  49.7  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  25.58 
 
 		 879 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  25.2 
 
 		 1237 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  43.1 
 
 		 875 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.62 
 
 		 986 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 1022 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.25 
 
 		 1207 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  31.69 
 
 		 702 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 		 790 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  52.94 
 
 		 1022 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  31 
 
 		 859 aa  45.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  52.94 
 
 		 859 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  52.94 
 
 		 859 aa  44.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  39.34 
 
 		 392 aa  44.3  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  36.54 
 
 		 514 aa  44.3  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0044  P115 protein  32.63 
 
 		 815 aa  44.3  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  26.85 
 
 		 935 aa  44.3  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  42 
 
 		 1023 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  28 
 
 		 1018 aa  44.3  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  50 
 
 		 1008 aa  44.3  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  26.5 
 
 		 1029 aa  43.9  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>