30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0005 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1356    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  23.11 
 
 		 677 aa  144  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  23.01 
 
 		 661 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  25.32 
 
 		 676 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  25.43 
 
 		 661 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  22.37 
 
 		 663 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  22.48 
 
 		 673 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  23.92 
 
 		 662 aa  120  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  22.53 
 
 		 671 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  22.82 
 
 		 660 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  28.51 
 
 		 668 aa  94  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  32.78 
 
 		 660 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  35.9 
 
 		 671 aa  92  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  30.13 
 
 		 436 aa  92  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  30.92 
 
 		 658 aa  90.9  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  22.22 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  40.59 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  24.73 
 
 		 690 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  31.25 
 
 		 660 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  20.09 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  30.83 
 
 		 395 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  30.5 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  29.66 
 
 		 354 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  32.52 
 
 		 683 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  25.79 
 
 		 690 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  25.23 
 
 		 642 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  22.43 
 
 		 693 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  22.43 
 
 		 693 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  23.68 
 
 		 686 aa  51.2  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  33.61 
 
 		 1074 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>