89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0358 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  100 
 
 
673 aa  1376    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  64.87 
 
 
677 aa  904    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  33.14 
 
 
671 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  30.58 
 
 
676 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  30.78 
 
 
666 aa  304  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  28.97 
 
 
664 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  27.49 
 
 
661 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  27.34 
 
 
661 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  27.96 
 
 
658 aa  244  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  27.61 
 
 
662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  27.71 
 
 
668 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  27.17 
 
 
663 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  24.75 
 
 
660 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  50 
 
 
660 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  35.11 
 
 
436 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  23.28 
 
 
672 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  33.33 
 
 
671 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  25.72 
 
 
663 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  29.31 
 
 
660 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  22.92 
 
 
690 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  31.95 
 
 
683 aa  93.6  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  23.39 
 
 
642 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  23.46 
 
 
690 aa  82  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  30.89 
 
 
657 aa  82  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  20.99 
 
 
699 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  29.05 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  22.24 
 
 
693 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  22.24 
 
 
693 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  29.31 
 
 
395 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  22.49 
 
 
804 aa  58.5  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  26.38 
 
 
926 aa  55.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  39.06 
 
 
1047 aa  54.7  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  25 
 
 
260 aa  53.9  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  24.36 
 
 
924 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.57 
 
 
789 aa  52  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  25.38 
 
 
686 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  38.96 
 
 
1346 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  30.83 
 
 
1022 aa  48.5  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  24.26 
 
 
890 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  30.56 
 
 
464 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  31.62 
 
 
1227 aa  48.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  30.99 
 
 
1227 aa  48.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.57 
 
 
1030 aa  48.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.25 
 
 
723 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  42.59 
 
 
1018 aa  48.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  42.59 
 
 
1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  42.59 
 
 
1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  42.59 
 
 
1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  42.59 
 
 
1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  31.43 
 
 
995 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  25.76 
 
 
1229 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  26.81 
 
 
1229 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  26.81 
 
 
1220 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  26.34 
 
 
1083 aa  46.6  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 
1144 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  32.14 
 
 
1137 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  29.46 
 
 
1247 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  36.71 
 
 
1088 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  31.71 
 
 
1029 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  42.62 
 
 
1042 aa  45.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  30.08 
 
 
1029 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  31.71 
 
 
1029 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  31.71 
 
 
1029 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  31.71 
 
 
1029 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  31.71 
 
 
1029 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  31.71 
 
 
1029 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  31.71 
 
 
1029 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  42.37 
 
 
1164 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  31.71 
 
 
1029 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  31.71 
 
 
1029 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  30.28 
 
 
1227 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  30.53 
 
 
1029 aa  45.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  27.59 
 
 
1013 aa  44.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  24.88 
 
 
888 aa  44.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  28.57 
 
 
892 aa  44.3  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  39.34 
 
 
1165 aa  43.9  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  40.68 
 
 
1227 aa  43.9  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  40.68 
 
 
1046 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  40.68 
 
 
1046 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  40.68 
 
 
1155 aa  43.9  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  29.22 
 
 
700 aa  43.9  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  40.68 
 
 
1048 aa  43.9  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  37.7 
 
 
1020 aa  43.9  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  40.68 
 
 
1047 aa  43.9  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  40.68 
 
 
1046 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  40.68 
 
 
1046 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  40.68 
 
 
1046 aa  43.9  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  40.68 
 
 
1047 aa  43.9  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  40.68 
 
 
1047 aa  43.9  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>