62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4571 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  100 
 
 		 671 aa  1328    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  31.81 
 
 		 673 aa  349  8e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  31.76 
 
 		 677 aa  341  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  35.8 
 
 		 664 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  32.34 
 
 		 661 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  32.2 
 
 		 661 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  31.4 
 
 		 666 aa  283  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  32.17 
 
 		 660 aa  278  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  29.29 
 
 		 668 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  30.13 
 
 		 658 aa  257  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  26.54 
 
 		 663 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  32.26 
 
 		 662 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  46.63 
 
 		 676 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  45.95 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  29.84 
 
 		 671 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  41.98 
 
 		 660 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  40.24 
 
 		 660 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  35.9 
 
 		 672 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  21.57 
 
 		 690 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  36.47 
 
 		 683 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  21.31 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  21.5 
 
 		 690 aa  77.4  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  39.53 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  25.43 
 
 		 657 aa  63.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 699 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  32.56 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  28.71 
 
 		 693 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  28.71 
 
 		 693 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  37.82 
 
 		 1020 aa  51.6  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  26.4 
 
 		 789 aa  51.2  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  41.82 
 
 		 1018 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  41.82 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  41.82 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  41.82 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  41.82 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  31.78 
 
 		 1018 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  28.47 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  23.93 
 
 		 804 aa  47.8  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.16 
 
 		 1013 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  32.14 
 
 		 1025 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  42.86 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  35.19 
 
 		 1017 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  38.18 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  38.6 
 
 		 1018 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 953 aa  45.8  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  32.62 
 
 		 1018 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  44.83 
 
 		 995 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  30.3 
 
 		 642 aa  45.8  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  44.07 
 
 		 1249 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  44.9 
 
 		 1020 aa  45.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  32.32 
 
 		 1081 aa  44.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  30.36 
 
 		 1227 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  21.84 
 
 		 704 aa  44.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  29.69 
 
 		 1023 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  32.73 
 
 		 1022 aa  44.3  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  39.47 
 
 		 1230 aa  44.3  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  36.76 
 
 		 891 aa  43.9  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  40.91 
 
 		 895 aa  43.9  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  44.83 
 
 		 986 aa  43.9  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  34.09 
 
 		 858 aa  43.9  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>