49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0470 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 666 aa  1353    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  52.11 
 
 		 676 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  30.7 
 
 		 677 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  30.78 
 
 		 673 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  31.41 
 
 		 671 aa  277  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  38 
 
 		 436 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  30.06 
 
 		 661 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  32.51 
 
 		 662 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  32.46 
 
 		 668 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  30.28 
 
 		 661 aa  256  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  29.81 
 
 		 658 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  30.09 
 
 		 660 aa  230  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  28.51 
 
 		 660 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  24.56 
 
 		 663 aa  185  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  24.2 
 
 		 671 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  25 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  39.75 
 
 		 664 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  22.07 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  23.35 
 
 		 657 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  34.27 
 
 		 683 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  40.59 
 
 		 672 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  23.02 
 
 		 699 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  22.76 
 
 		 690 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  35.79 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  30.69 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  21.84 
 
 		 642 aa  63.9  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  22.12 
 
 		 427 aa  56.6  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  24.54 
 
 		 260 aa  55.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  26.4 
 
 		 686 aa  53.9  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  25.49 
 
 		 690 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 		 1190 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.41 
 
 		 961 aa  49.3  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0003  recombination protein F  45.9 
 
 		 364 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0185053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0003  recombination protein F  45.9 
 
 		 364 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.26612  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  44.07 
 
 		 794 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  32.69 
 
 		 1319 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  37.35 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  41.67 
 
 		 1226 aa  45.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  33.02 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 804 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1164 aa  45.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1164 aa  45.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  25.9 
 
 		 875 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  22.93 
 
 		 693 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  27.43 
 
 		 1162 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  27.43 
 
 		 1162 aa  44.3  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  22.93 
 
 		 693 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  42.86 
 
 		 1018 aa  43.9  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  28.57 
 
 		 1162 aa  43.9  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>