75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2920 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  100 
 
 		 693 aa  1417    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  58.64 
 
 		 690 aa  826    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  56.67 
 
 		 690 aa  802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  99.86 
 
 		 693 aa  1417    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  26.89 
 
 		 699 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  24.3 
 
 		 663 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  25.32 
 
 		 686 aa  145  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  24.02 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  21.78 
 
 		 704 aa  98.2  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  22.14 
 
 		 677 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4565  hypothetical protein  22.84 
 
 		 665 aa  75.5  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  28.08 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  21.79 
 
 		 671 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  22.08 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  20.6 
 
 		 658 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  22.91 
 
 		 668 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  28.97 
 
 		 673 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  21.69 
 
 		 661 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  22.15 
 
 		 924 aa  58.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  20.88 
 
 		 642 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  31.2 
 
 		 395 aa  56.6  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  24.38 
 
 		 427 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  28.71 
 
 		 671 aa  54.3  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  25.74 
 
 		 895 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  31.19 
 
 		 1085 aa  51.2  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  22.43 
 
 		 672 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  32.87 
 
 		 1088 aa  51.2  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  30.37 
 
 		 1091 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  27.43 
 
 		 683 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  28.35 
 
 		 1223 aa  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  25.77 
 
 		 260 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  27.05 
 
 		 660 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  35.64 
 
 		 1091 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  26.45 
 
 		 989 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  40.74 
 
 		 1021 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  26.05 
 
 		 661 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  26.52 
 
 		 1029 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  24.32 
 
 		 660 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  31 
 
 		 1226 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  25.76 
 
 		 1029 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  27.61 
 
 		 1227 aa  46.6  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  23 
 
 		 840 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  27.97 
 
 		 1144 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  26.17 
 
 		 676 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  29.89 
 
 		 1029 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  28.15 
 
 		 1164 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.89 
 
 		 1029 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  29.89 
 
 		 1029 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  29.89 
 
 		 1029 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  33 
 
 		 1307 aa  45.8  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  29.89 
 
 		 1029 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  29.89 
 
 		 1029 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  29.89 
 
 		 1029 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  27.41 
 
 		 1047 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  28.06 
 
 		 1227 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  27.41 
 
 		 1047 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  27.41 
 
 		 1048 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  26.92 
 
 		 1137 aa  44.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1048 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  27.41 
 
 		 1048 aa  44.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  37.74 
 
 		 514 aa  44.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  33.33 
 
 		 978 aa  44.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  27.41 
 
 		 1047 aa  44.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  27.41 
 
 		 1047 aa  44.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  27.41 
 
 		 1047 aa  44.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  27.41 
 
 		 1047 aa  44.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  26.77 
 
 		 1224 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  32.08 
 
 		 986 aa  44.3  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  27.91 
 
 		 1229 aa  44.3  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  27.2 
 
 		 1042 aa  44.3  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  27.91 
 
 		 1229 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  27.91 
 
 		 1220 aa  44.3  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  26.13 
 
 		 664 aa  44.3  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  22.93 
 
 		 666 aa  44.3  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.98 
 
 		 1180 aa  43.9  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>