86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1931 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  59.76 
 
 		 661 aa  792    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1336    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  56.84 
 
 		 668 aa  732    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  59.13 
 
 		 662 aa  782    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  59.46 
 
 		 661 aa  790    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  33.87 
 
 		 658 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  32.75 
 
 		 664 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  31.74 
 
 		 671 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  29.41 
 
 		 677 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  30.64 
 
 		 676 aa  253  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  30.72 
 
 		 666 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  28.43 
 
 		 673 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  27.94 
 
 		 660 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  26.74 
 
 		 660 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  23.83 
 
 		 663 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  40.36 
 
 		 436 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  25.07 
 
 		 683 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  29.07 
 
 		 671 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  30.36 
 
 		 672 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  22.21 
 
 		 690 aa  74.3  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  20.57 
 
 		 693 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  20.43 
 
 		 693 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  35.4 
 
 		 395 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  35.58 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  27.82 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  21.9 
 
 		 690 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  24.6 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  31.36 
 
 		 1039 aa  57.8  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  36.96 
 
 		 1049 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  38.57 
 
 		 1013 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  25.51 
 
 		 686 aa  55.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  31.21 
 
 		 1020 aa  54.7  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  30.56 
 
 		 1017 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  37.8 
 
 		 1009 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  28.93 
 
 		 1020 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  44.78 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  34.21 
 
 		 1020 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  33.91 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  39.06 
 
 		 1024 aa  51.6  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  29.71 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  26.5 
 
 		 902 aa  51.2  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  29.23 
 
 		 657 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  31.62 
 
 		 1022 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  44.78 
 
 		 1018 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  40.3 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  43.86 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  40.3 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  31.63 
 
 		 1038 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  41.79 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  43.86 
 
 		 1018 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  33.1 
 
 		 1030 aa  48.9  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  35.94 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  32.77 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  40.35 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  42.11 
 
 		 1018 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.66 
 
 		 906 aa  47.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  38.81 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  41.38 
 
 		 995 aa  47.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  38.81 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  27.96 
 
 		 804 aa  47.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  39.06 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  28.67 
 
 		 1018 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  27.96 
 
 		 1006 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  40.35 
 
 		 986 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  38.89 
 
 		 1029 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  32.61 
 
 		 1031 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  30.08 
 
 		 1033 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  36.76 
 
 		 986 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  39.66 
 
 		 962 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  32.61 
 
 		 1029 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  30.58 
 
 		 1081 aa  45.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  40.74 
 
 		 950 aa  45.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  25.09 
 
 		 260 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  32.61 
 
 		 1029 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  38.89 
 
 		 1029 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  32.61 
 
 		 1029 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  32.61 
 
 		 1029 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  32.61 
 
 		 1029 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  32.61 
 
 		 1029 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  32.61 
 
 		 1029 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  32.61 
 
 		 1029 aa  44.3  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  32.61 
 
 		 1029 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  38.33 
 
 		 995 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  22.93 
 
 		 890 aa  43.9  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.26 
 
 		 723 aa  43.9  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>