56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2151 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  58.64 
 
 
693 aa  827    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  58.64 
 
 
693 aa  826    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  100 
 
 
690 aa  1415    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  59.88 
 
 
690 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  26.17 
 
 
699 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  25 
 
 
663 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  22.66 
 
 
686 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  19.94 
 
 
657 aa  88.6  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  24.23 
 
 
662 aa  88.2  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  21.6 
 
 
677 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  22.55 
 
 
658 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  21.15 
 
 
671 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  20.67 
 
 
704 aa  77.4  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  22.79 
 
 
661 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  22.76 
 
 
666 aa  75.1  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  21.05 
 
 
671 aa  74.7  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  22.65 
 
 
661 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  27.37 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  23.28 
 
 
668 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  28.77 
 
 
673 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  22.74 
 
 
395 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4565  hypothetical protein  21.78 
 
 
665 aa  61.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  26.6 
 
 
676 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  25.79 
 
 
672 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  21.42 
 
 
664 aa  51.2  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  24.04 
 
 
683 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  30.77 
 
 
1029 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  30.77 
 
 
1029 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  30.21 
 
 
1232 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  24.42 
 
 
436 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  30.89 
 
 
1029 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  30.89 
 
 
1029 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  30.89 
 
 
1029 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  30.89 
 
 
1029 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  19.19 
 
 
642 aa  48.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  30.89 
 
 
1029 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  30.89 
 
 
1029 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  30.89 
 
 
1029 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  33.7 
 
 
1280 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  23.53 
 
 
260 aa  47.4  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  29.46 
 
 
1029 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  25.51 
 
 
660 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  38.89 
 
 
1021 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  32.97 
 
 
1307 aa  46.6  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  30.89 
 
 
1029 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  25.76 
 
 
953 aa  45.8  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1170 aa  45.4  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  27.27 
 
 
986 aa  45.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1170 aa  45.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  32.97 
 
 
1318 aa  45.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  39.62 
 
 
514 aa  44.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.99 
 
 
1153 aa  44.3  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  22.83 
 
 
1020 aa  44.3  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  41.27 
 
 
1082 aa  44.3  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  30.77 
 
 
1031 aa  43.9  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  21.62 
 
 
840 aa  43.9  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>