45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2307 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  100 
 
 
676 aa  1377    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  52.11 
 
 
666 aa  661    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  30.98 
 
 
673 aa  308  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  39.13 
 
 
436 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  29.71 
 
 
677 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  30.9 
 
 
661 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  31.27 
 
 
661 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  29.62 
 
 
662 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  29.01 
 
 
658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  29.91 
 
 
664 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  31.02 
 
 
668 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  30.7 
 
 
660 aa  232  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  26.03 
 
 
663 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  24.71 
 
 
671 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  26.38 
 
 
660 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  46.63 
 
 
671 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  23.45 
 
 
660 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  25.18 
 
 
672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  33.53 
 
 
683 aa  90.1  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  23.47 
 
 
663 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  32.04 
 
 
699 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  21.99 
 
 
642 aa  73.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  40.62 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  29.57 
 
 
395 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  26.6 
 
 
690 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  22.28 
 
 
427 aa  56.2  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  23.94 
 
 
260 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  26.02 
 
 
686 aa  56.6  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.14 
 
 
891 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  26.92 
 
 
704 aa  54.3  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  26.48 
 
 
961 aa  49.7  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  24.88 
 
 
690 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  26.73 
 
 
1125 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  28.07 
 
 
795 aa  47.4  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  36 
 
 
1232 aa  47.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  26.17 
 
 
693 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  33.33 
 
 
890 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  26.17 
 
 
693 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.92 
 
 
895 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  28.24 
 
 
794 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  28.57 
 
 
955 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  25.16 
 
 
995 aa  44.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  33.33 
 
 
950 aa  44.3  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  25 
 
 
790 aa  44.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.77 
 
 
924 aa  43.9  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>