45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2480 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 699 aa  1418    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  27.31 
 
 		 690 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  26.89 
 
 		 693 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  27.27 
 
 		 693 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  26.17 
 
 		 690 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  24.04 
 
 		 663 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  24.05 
 
 		 642 aa  97.8  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  22.1 
 
 		 677 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  21.82 
 
 		 686 aa  92  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  32.04 
 
 		 676 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  23.02 
 
 		 666 aa  80.9  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  23.24 
 
 		 661 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  27.63 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  22.66 
 
 		 661 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  25.36 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  28.22 
 
 		 658 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  20.58 
 
 		 673 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  23.56 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  22.82 
 
 		 683 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  29.36 
 
 		 671 aa  62  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 		 1057 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  24.65 
 
 		 664 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  24.1 
 
 		 260 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  27.27 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  25.95 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  24.17 
 
 		 660 aa  54.3  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  49.12 
 
 		 955 aa  52.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  33.62 
 
 		 895 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  30.36 
 
 		 924 aa  47.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  32.38 
 
 		 890 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  40.82 
 
 		 514 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  38.18 
 
 		 1291 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  27.41 
 
 		 902 aa  45.8  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  22.3 
 
 		 395 aa  45.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  28.83 
 
 		 891 aa  45.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 1249 aa  45.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  37.04 
 
 		 1061 aa  45.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4194  ABC transporter related  34.21 
 
 		 515 aa  44.3  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  23.78 
 
 		 790 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  39.58 
 
 		 879 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  41.51 
 
 		 794 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 662 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  24.41 
 
 		 1020 aa  43.9  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  41.51 
 
 		 795 aa  44.3  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  30.48 
 
 		 1013 aa  43.9  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>