More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0371 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  56.92 
 
 		 891 aa  887    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  100 
 
 		 890 aa  1703    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  52.14 
 
 		 902 aa  699    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  51.68 
 
 		 924 aa  776    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  54.99 
 
 		 895 aa  785    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  33.59 
 
 		 888 aa  429  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  28.3 
 
 		 926 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  34.45 
 
 		 1074 aa  245  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  28.39 
 
 		 804 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.75 
 
 		 858 aa  139  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  20.54 
 
 		 994 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  21.61 
 
 		 891 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  24.15 
 
 		 802 aa  122  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  23.22 
 
 		 993 aa  122  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.59 
 
 		 864 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  25.73 
 
 		 1019 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.74 
 
 		 993 aa  111  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  22.1 
 
 		 993 aa  108  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  24.28 
 
 		 859 aa  107  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  31.8 
 
 		 1031 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  31.15 
 
 		 1023 aa  94.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  30.39 
 
 		 1007 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  23.64 
 
 		 1021 aa  90.9  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  31.7 
 
 		 1003 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  27.55 
 
 		 1016 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.4 
 
 		 1108 aa  88.6  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.05 
 
 		 906 aa  88.6  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  27.37 
 
 		 1019 aa  87.8  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  30.91 
 
 		 852 aa  86.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  30.91 
 
 		 852 aa  86.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  28.67 
 
 		 1022 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  26.07 
 
 		 978 aa  85.9  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  31.61 
 
 		 1008 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  32.64 
 
 		 1022 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  29.7 
 
 		 693 aa  84.3  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  30.69 
 
 		 1007 aa  81.6  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  30.47 
 
 		 1061 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  26.78 
 
 		 950 aa  79.3  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30.73 
 
 		 851 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  33.92 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  26.26 
 
 		 987 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  25.17 
 
 		 1008 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  26.73 
 
 		 987 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  25.17 
 
 		 1008 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  31.06 
 
 		 1038 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  22.85 
 
 		 984 aa  75.5  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  29.59 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.98 
 
 		 935 aa  74.7  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  27.87 
 
 		 702 aa  73.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  23.37 
 
 		 862 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  27.55 
 
 		 1057 aa  73.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 		 1188 aa  72.4  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  35.46 
 
 		 910 aa  72.4  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  29.26 
 
 		 1099 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  30.63 
 
 		 1234 aa  70.1  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  30.46 
 
 		 815 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  27.5 
 
 		 702 aa  68.6  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  24.18 
 
 		 1177 aa  68.2  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.56 
 
 		 1193 aa  65.1  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  29.88 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.19 
 
 		 961 aa  64.7  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  24.31 
 
 		 790 aa  63.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  21.56 
 
 		 1189 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  26.88 
 
 		 1139 aa  62.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  27.05 
 
 		 1175 aa  61.6  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.46 
 
 		 1174 aa  61.6  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  28.02 
 
 		 824 aa  61.2  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  24.67 
 
 		 794 aa  61.2  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1151 aa  61.2  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  23.12 
 
 		 1179 aa  60.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  29.23 
 
 		 1153 aa  60.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  24.6 
 
 		 1011 aa  60.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  28.02 
 
 		 1235 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  29.89 
 
 		 1151 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  27.36 
 
 		 1202 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  30.69 
 
 		 904 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  22.11 
 
 		 1189 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.81 
 
 		 1190 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  20.78 
 
 		 1185 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  31.12 
 
 		 1020 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  28.16 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.79 
 
 		 1134 aa  58.9  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  25.87 
 
 		 1187 aa  58.9  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  32.34 
 
 		 1103 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  23.64 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  21.41 
 
 		 1189 aa  58.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  22.66 
 
 		 1030 aa  58.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  28.26 
 
 		 1150 aa  58.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  20.99 
 
 		 1189 aa  58.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 		 1204 aa  57.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  29.31 
 
 		 953 aa  57.4  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  31.82 
 
 		 814 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  28.28 
 
 		 1151 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  27.2 
 
 		 1217 aa  57  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  27.08 
 
 		 1203 aa  57.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 		 1167 aa  57.4  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  28.8 
 
 		 1170 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  23.06 
 
 		 1179 aa  56.6  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  28.25 
 
 		 1153 aa  56.6  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  28.8 
 
 		 1170 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>