More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3877 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  56.05 
 
 		 1008 aa  1035    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  52.5 
 
 		 1007 aa  938    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  50.84 
 
 		 1003 aa  897    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  46.61 
 
 		 1008 aa  793    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  46.52 
 
 		 1008 aa  791    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1016 aa  2040    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  48.73 
 
 		 1007 aa  860    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  31.32 
 
 		 1023 aa  425  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  28.64 
 
 		 1022 aa  362  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  29.53 
 
 		 1022 aa  357  5.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  30.42 
 
 		 1019 aa  335  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  27.87 
 
 		 1031 aa  234  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  35.28 
 
 		 859 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  31.77 
 
 		 859 aa  199  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  36.77 
 
 		 859 aa  199  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  41.41 
 
 		 857 aa  168  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  34.97 
 
 		 1000 aa  141  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.88 
 
 		 906 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.46 
 
 		 891 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  22.04 
 
 		 1061 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  23.16 
 
 		 1018 aa  110  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.76 
 
 		 895 aa  104  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  23.96 
 
 		 994 aa  102  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  33.33 
 
 		 902 aa  102  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  30.62 
 
 		 961 aa  101  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  22.84 
 
 		 993 aa  99.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  21.37 
 
 		 993 aa  97.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.37 
 
 		 891 aa  97.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  29.58 
 
 		 824 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  31.43 
 
 		 924 aa  95.5  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25.27 
 
 		 978 aa  92.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  21.93 
 
 		 1009 aa  91.3  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  27.21 
 
 		 890 aa  89  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  29.63 
 
 		 824 aa  83.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  30.35 
 
 		 1155 aa  80.9  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  32.09 
 
 		 851 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  23.82 
 
 		 993 aa  79  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  26.94 
 
 		 789 aa  78.2  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  25.17 
 
 		 1247 aa  78.2  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  23.48 
 
 		 693 aa  76.6  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.66 
 
 		 702 aa  77  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  24.75 
 
 		 1039 aa  77  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 852 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 852 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  26.34 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  22.17 
 
 		 1032 aa  74.7  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  21.82 
 
 		 864 aa  73.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  23.55 
 
 		 1099 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  23.99 
 
 		 1088 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  26.42 
 
 		 1011 aa  73.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24.31 
 
 		 858 aa  72.8  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  21.68 
 
 		 1049 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  28.3 
 
 		 1103 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  29.03 
 
 		 1029 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  32.6 
 
 		 810 aa  72  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  29.27 
 
 		 1229 aa  71.2  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  29.27 
 
 		 1229 aa  71.2  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  29.27 
 
 		 1220 aa  71.2  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.05 
 
 		 1074 aa  71.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  28.22 
 
 		 1227 aa  71.2  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  28 
 
 		 1018 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  30.1 
 
 		 1114 aa  71.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  25.21 
 
 		 995 aa  70.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  30.07 
 
 		 1029 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  25.46 
 
 		 1346 aa  70.1  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  21.66 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  26.01 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  27.87 
 
 		 888 aa  69.7  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.75 
 
 		 935 aa  69.3  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  30.11 
 
 		 1020 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  28.27 
 
 		 1047 aa  68.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  27.89 
 
 		 1227 aa  68.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.34 
 
 		 1177 aa  68.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.43 
 
 		 702 aa  68.9  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  27.43 
 
 		 1165 aa  68.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  29.21 
 
 		 1018 aa  68.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  27.37 
 
 		 815 aa  67.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.78 
 
 		 1021 aa  67.4  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.21 
 
 		 1029 aa  67.4  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  28.57 
 
 		 1029 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  28.57 
 
 		 1029 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  23.15 
 
 		 700 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  28.57 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  32.23 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.57 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.57 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  27.72 
 
 		 912 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.57 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  26.21 
 
 		 1227 aa  66.6  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  31.15 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  31.15 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 1018 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.57 
 
 		 1029 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  30.89 
 
 		 1018 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  31.15 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  23.64 
 
 		 1046 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  31.15 
 
 		 1018 aa  66.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  28.45 
 
 		 1227 aa  65.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  26.45 
 
 		 1232 aa  65.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  20.82 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>