More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0762 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 858 aa  1681    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  32.24 
 
 		 864 aa  360  8e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  25.74 
 
 		 891 aa  188  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  22.29 
 
 		 994 aa  159  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  25.03 
 
 		 702 aa  148  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.94 
 
 		 804 aa  144  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  27.67 
 
 		 702 aa  140  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  26.29 
 
 		 702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  26.42 
 
 		 891 aa  123  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.72 
 
 		 890 aa  114  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.25 
 
 		 961 aa  112  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  30.22 
 
 		 993 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  25.96 
 
 		 993 aa  108  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  31.38 
 
 		 1019 aa  107  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  24.26 
 
 		 926 aa  101  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  33.97 
 
 		 993 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.55 
 
 		 935 aa  95.9  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  22.32 
 
 		 1061 aa  87.8  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  23.99 
 
 		 790 aa  87  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.4 
 
 		 924 aa  85.1  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  28 
 
 		 700 aa  84  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  26.77 
 
 		 895 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  22.94 
 
 		 1021 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  28.62 
 
 		 693 aa  81.6  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  30.23 
 
 		 1074 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  22.1 
 
 		 1031 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  22.98 
 
 		 795 aa  77.4  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  23.02 
 
 		 805 aa  76.3  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  21.56 
 
 		 1019 aa  75.1  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  25.29 
 
 		 784 aa  73.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  23.43 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  24.26 
 
 		 794 aa  71.6  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  26.79 
 
 		 852 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  22.75 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  22.96 
 
 		 857 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  26.26 
 
 		 852 aa  68.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  22.65 
 
 		 862 aa  68.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  30.08 
 
 		 1008 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  30.99 
 
 		 1003 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  24.63 
 
 		 859 aa  67.4  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  30.13 
 
 		 912 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  24.31 
 
 		 1016 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  22 
 
 		 906 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  26.86 
 
 		 1007 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.89 
 
 		 859 aa  63.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  25.27 
 
 		 1162 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  24.29 
 
 		 1008 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  30.71 
 
 		 224 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  24.29 
 
 		 1008 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  23.35 
 
 		 1057 aa  63.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  23.89 
 
 		 1175 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  27.82 
 
 		 1007 aa  62.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  38.78 
 
 		 802 aa  62.4  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  32.64 
 
 		 851 aa  61.6  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  36.26 
 
 		 814 aa  61.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  27.55 
 
 		 1162 aa  60.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 		 1162 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  32.32 
 
 		 922 aa  60.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  25.11 
 
 		 719 aa  60.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  21.41 
 
 		 1029 aa  60.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  25.35 
 
 		 1162 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1170 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  23.17 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  27.78 
 
 		 1162 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  25.76 
 
 		 1162 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  28.81 
 
 		 1115 aa  59.3  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  26.1 
 
 		 1162 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  26.06 
 
 		 1194 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  23.97 
 
 		 1153 aa  58.9  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  25.76 
 
 		 1162 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  21.21 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1185 aa  57.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  24.93 
 
 		 1306 aa  57.8  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  32.76 
 
 		 829 aa  57.4  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  23.15 
 
 		 978 aa  57.4  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  40 
 
 		 230 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  37.63 
 
 		 1319 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  47.92 
 
 		 813 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  27.72 
 
 		 1168 aa  56.6  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  25.07 
 
 		 1162 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  38.04 
 
 		 987 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  23.73 
 
 		 902 aa  57  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1194 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  22.61 
 
 		 1171 aa  57  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  41.25 
 
 		 225 aa  55.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  24.54 
 
 		 445 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1164 aa  55.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1164 aa  55.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  25.24 
 
 		 1177 aa  55.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  25.54 
 
 		 1313 aa  55.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  40 
 
 		 232 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30 
 
 		 1173 aa  55.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  23.8 
 
 		 796 aa  55.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  35.56 
 
 		 987 aa  55.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  27.11 
 
 		 978 aa  55.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  26.47 
 
 		 1169 aa  55.1  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.56 
 
 		 1181 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1217 aa  55.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  42.31 
 
 		 253 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  26.47 
 
 		 1169 aa  54.7  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>