More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2343 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  100 
 
 		 912 aa  1818    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  26.24 
 
 		 1021 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  46.13 
 
 		 922 aa  230  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.78 
 
 		 935 aa  172  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  24.59 
 
 		 984 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  28.19 
 
 		 987 aa  101  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.28 
 
 		 813 aa  97.8  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  19.83 
 
 		 891 aa  97.8  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  28.53 
 
 		 987 aa  97.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  24.39 
 
 		 814 aa  95.5  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  26.05 
 
 		 994 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  30.92 
 
 		 1003 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.93 
 
 		 864 aa  77  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  20.48 
 
 		 993 aa  75.1  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 804 aa  74.3  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  21.66 
 
 		 993 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  20.9 
 
 		 993 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.81 
 
 		 1187 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  27.44 
 
 		 1008 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 858 aa  68.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.08 
 
 		 1008 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.85 
 
 		 1185 aa  67.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  26.11 
 
 		 1007 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  28.99 
 
 		 1019 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.51 
 
 		 1031 aa  65.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  25.87 
 
 		 1016 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  24.52 
 
 		 1255 aa  65.1  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  27.63 
 
 		 902 aa  64.3  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.27 
 
 		 1187 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 		 693 aa  62.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  28.14 
 
 		 1061 aa  62.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  24.18 
 
 		 1187 aa  62.4  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  21.14 
 
 		 1189 aa  61.6  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.74 
 
 		 1184 aa  61.6  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.21 
 
 		 1191 aa  60.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.36 
 
 		 1029 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  25.95 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  26.1 
 
 		 1185 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  20.66 
 
 		 1108 aa  59.3  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  30.68 
 
 		 924 aa  58.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  32.95 
 
 		 895 aa  58.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  31 
 
 		 1172 aa  58.2  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  32.79 
 
 		 874 aa  57.4  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  21.43 
 
 		 1176 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  42.31 
 
 		 339 aa  57.4  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  35.56 
 
 		 1188 aa  57.4  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  36.36 
 
 		 1209 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  26.86 
 
 		 1218 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  35.96 
 
 		 1188 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  30.48 
 
 		 789 aa  56.6  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  26.32 
 
 		 1205 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  35.71 
 
 		 531 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  25.84 
 
 		 1195 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  20.23 
 
 		 1188 aa  56.6  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  25.84 
 
 		 1195 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1184 aa  56.2  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  34.83 
 
 		 1191 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  34.83 
 
 		 1214 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  25.84 
 
 		 1195 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 		 1179 aa  55.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  32.58 
 
 		 1227 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  23.76 
 
 		 1029 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.57 
 
 		 1177 aa  56.2  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  46 
 
 		 422 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  52.17 
 
 		 340 aa  55.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  35.29 
 
 		 1194 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  33.71 
 
 		 1199 aa  55.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  25.24 
 
 		 859 aa  55.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 		 1191 aa  55.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  31.13 
 
 		 955 aa  55.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  24.62 
 
 		 1178 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1194 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  26.21 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  21.72 
 
 		 1190 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  32.22 
 
 		 1195 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  24.5 
 
 		 1198 aa  55.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1217 aa  55.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1194 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  32.67 
 
 		 483 aa  55.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1194 aa  54.7  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1263 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  32 
 
 		 1222 aa  55.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  38.03 
 
 		 702 aa  55.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  24.21 
 
 		 1057 aa  54.7  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 		 1234 aa  54.7  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  45.1 
 
 		 427 aa  54.7  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 702 aa  54.7  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 		 1203 aa  54.3  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 		 1217 aa  53.9  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  36.67 
 
 		 1208 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  29.13 
 
 		 1125 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  21.29 
 
 		 1196 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  47.83 
 
 		 387 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  36.99 
 
 		 582 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  29.9 
 
 		 553 aa  53.9  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  21.72 
 
 		 802 aa  54.3  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  33.12 
 
 		 851 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  27.83 
 
 		 1234 aa  54.3  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  32.38 
 
 		 1306 aa  54.3  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  23.42 
 
 		 1186 aa  54.3  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>