107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53629 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  100 
 
 
1306 aa  2631    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.440366 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  32.25 
 
 
1319 aa  612  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  30.54 
 
 
1313 aa  466  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01100  telomere maintenance protein, putative  36.35 
 
 
1289 aa  271  8e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28116  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  34.62 
 
 
1436 aa  242  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  35.96 
 
 
891 aa  58.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  27.23 
 
 
864 aa  57.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24.93 
 
 
858 aa  57.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  32.61 
 
 
693 aa  57  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  34.07 
 
 
1195 aa  55.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 
1133 aa  55.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  27.37 
 
 
1173 aa  53.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  35.87 
 
 
635 aa  53.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  32.38 
 
 
912 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  27.48 
 
 
987 aa  52.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  30.77 
 
 
1164 aa  52.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  28.07 
 
 
1162 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  27.18 
 
 
987 aa  52.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
631 aa  52  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  35.87 
 
 
1204 aa  51.6  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  22.77 
 
 
1181 aa  51.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 
630 aa  51.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  28.97 
 
 
1162 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  29.67 
 
 
1164 aa  50.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  29.67 
 
 
1164 aa  50.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  28.97 
 
 
1162 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  20.7 
 
 
702 aa  50.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1140 aa  50.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 
1194 aa  50.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  29.25 
 
 
1199 aa  49.7  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 
1162 aa  49.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  35.56 
 
 
535 aa  48.9  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 
1163 aa  48.9  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 
984 aa  48.9  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 
299 aa  48.9  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  38.36 
 
 
526 aa  48.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  24.14 
 
 
805 aa  48.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 
1185 aa  48.5  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  38.24 
 
 
922 aa  48.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  27.64 
 
 
1138 aa  47.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  20.74 
 
 
784 aa  48.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 
1176 aa  48.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  26.13 
 
 
1198 aa  47.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 
1176 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  30.19 
 
 
1217 aa  47.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  34.43 
 
 
1307 aa  47  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 
1185 aa  47.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 
1168 aa  47  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.61 
 
 
1190 aa  47.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1138 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1138 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1138 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1138 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  50.91 
 
 
528 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 
502 aa  46.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 
1190 aa  46.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  34.43 
 
 
1318 aa  46.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
642 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  36.71 
 
 
642 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1145 aa  46.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  31.68 
 
 
634 aa  46.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  30.19 
 
 
366 aa  47  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34 
 
 
813 aa  46.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
530 aa  46.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  25.44 
 
 
1187 aa  46.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  34.43 
 
 
1280 aa  46.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2370  ABC transporter related  36.99 
 
 
536 aa  46.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  23.7 
 
 
1186 aa  46.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0218  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
525 aa  46.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  34.18 
 
 
660 aa  46.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.52 
 
 
1185 aa  46.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  30 
 
 
1151 aa  45.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.89 
 
 
1168 aa  45.8  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 
1170 aa  45.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  27.87 
 
 
1171 aa  45.8  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
220 aa  45.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  32.65 
 
 
814 aa  45.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  28.21 
 
 
1164 aa  45.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1142 aa  45.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1142 aa  45.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1142 aa  45.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  32.18 
 
 
1170 aa  45.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.58 
 
 
1190 aa  45.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1528  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
632 aa  45.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  27.47 
 
 
1145 aa  45.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.41 
 
 
1178 aa  45.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  36.92 
 
 
530 aa  45.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  28.09 
 
 
1162 aa  45.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  28.86 
 
 
1180 aa  45.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 
1144 aa  45.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3311  ABC transporter related  38.46 
 
 
527 aa  45.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.819079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>