152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1375 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  58.32 
 
 		 813 aa  917    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  100 
 
 		 814 aa  1634    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  44.47 
 
 		 987 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  52.09 
 
 		 987 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.14 
 
 		 935 aa  117  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  29.26 
 
 		 1021 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  29.38 
 
 		 984 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  24.77 
 
 		 812 aa  91.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  30.06 
 
 		 912 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  34.83 
 
 		 922 aa  79.7  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.85 
 
 		 993 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  24.17 
 
 		 993 aa  74.3  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  25.5 
 
 		 993 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  34.09 
 
 		 1019 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  34.69 
 
 		 994 aa  64.3  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.05 
 
 		 864 aa  63.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  34.02 
 
 		 802 aa  63.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.73 
 
 		 891 aa  63.9  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  30.65 
 
 		 1007 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.34 
 
 		 906 aa  61.2  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  26.84 
 
 		 910 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  36.26 
 
 		 858 aa  60.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  31.41 
 
 		 1023 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  37.08 
 
 		 693 aa  60.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  34.94 
 
 		 702 aa  59.3  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  37.63 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  35.53 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  35.16 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  31.11 
 
 		 852 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  31.11 
 
 		 852 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  32.22 
 
 		 891 aa  57.4  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  36.78 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  25.42 
 
 		 1016 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  32.53 
 
 		 804 aa  57  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  32.89 
 
 		 1074 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  28.96 
 
 		 1008 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  46 
 
 		 483 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  29.71 
 
 		 810 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  25.64 
 
 		 1199 aa  55.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  28.19 
 
 		 795 aa  54.7  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  34.41 
 
 		 702 aa  55.1  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  25 
 
 		 789 aa  54.7  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  30.95 
 
 		 890 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  36.14 
 
 		 888 aa  54.3  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.48 
 
 		 1059 aa  53.9  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  25.64 
 
 		 1194 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  32.47 
 
 		 924 aa  53.5  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  44.44 
 
 		 340 aa  53.9  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 		 1177 aa  53.5  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1146 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  40 
 
 		 387 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  36.17 
 
 		 851 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  29.41 
 
 		 1149 aa  52.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  44.44 
 
 		 339 aa  52  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  25.09 
 
 		 1019 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  35.79 
 
 		 955 aa  51.6  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  39.29 
 
 		 531 aa  51.6  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.13 
 
 		 1057 aa  51.6  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  25.68 
 
 		 1208 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  32.56 
 
 		 895 aa  51.2  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.93 
 
 		 520 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  26.7 
 
 		 794 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  38 
 
 		 806 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  30.06 
 
 		 1031 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  27.31 
 
 		 1183 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  27.56 
 
 		 1186 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  28.29 
 
 		 1061 aa  48.5  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  26.7 
 
 		 790 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  34.62 
 
 		 1313 aa  48.9  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  28.67 
 
 		 554 aa  48.9  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  36 
 
 		 562 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  29.86 
 
 		 553 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  27.45 
 
 		 1198 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  19.35 
 
 		 1189 aa  48.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  38 
 
 		 1191 aa  48.1  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  42.31 
 
 		 829 aa  48.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  30.49 
 
 		 531 aa  47.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  38.67 
 
 		 1011 aa  47.8  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  43.48 
 
 		 1081 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  25.68 
 
 		 1205 aa  47.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  33.71 
 
 		 1226 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 		 1190 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  27.66 
 
 		 618 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  31.33 
 
 		 1125 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1146 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  33.71 
 
 		 1226 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  46.81 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.25 
 
 		 365 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  25.25 
 
 		 1227 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  29 
 
 		 1147 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  26.03 
 
 		 1194 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 		 1189 aa  46.6  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  30.49 
 
 		 581 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  29.55 
 
 		 805 aa  47  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  18.96 
 
 		 1189 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  25.1 
 
 		 1180 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  30.97 
 
 		 557 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.67 
 
 		 363 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.59 
 
 		 370 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 		 1217 aa  46.2  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>