96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1213 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 806 aa  1569    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  27.95 
 
 		 862 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  42.6 
 
 		 802 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  26.71 
 
 		 693 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.97 
 
 		 993 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  29.13 
 
 		 993 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  26.67 
 
 		 891 aa  74.7  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  22.24 
 
 		 804 aa  73.9  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  32.47 
 
 		 994 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  28.15 
 
 		 993 aa  72  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  22.52 
 
 		 924 aa  67.8  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  25.68 
 
 		 1019 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.44 
 
 		 1029 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  27.37 
 
 		 1021 aa  65.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  29.85 
 
 		 978 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  26.88 
 
 		 1038 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.44 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 		 702 aa  62  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  27.49 
 
 		 1029 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  27.49 
 
 		 1029 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  27.49 
 
 		 1029 aa  61.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  27.49 
 
 		 1029 aa  61.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  27.49 
 
 		 1029 aa  61.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  27.49 
 
 		 1029 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  30.72 
 
 		 852 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  27.96 
 
 		 1029 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  30.72 
 
 		 852 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  29.38 
 
 		 1018 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.59 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  32.37 
 
 		 895 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 1057 aa  59.3  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  28.57 
 
 		 1049 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.01 
 
 		 1029 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  31.37 
 
 		 1009 aa  59.3  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  28.81 
 
 		 1018 aa  58.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  27.96 
 
 		 1029 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  31.01 
 
 		 987 aa  58.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  21.57 
 
 		 813 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  30.23 
 
 		 987 aa  55.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.29 
 
 		 890 aa  54.3  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  31.25 
 
 		 1081 aa  54.3  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  19.49 
 
 		 1031 aa  54.3  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  26.56 
 
 		 1234 aa  53.9  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  38.64 
 
 		 926 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  23.09 
 
 		 812 aa  53.5  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  28.15 
 
 		 859 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  22.76 
 
 		 906 aa  52.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  21.79 
 
 		 891 aa  52.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25.45 
 
 		 902 aa  51.6  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  24.52 
 
 		 1061 aa  51.2  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  25.3 
 
 		 1020 aa  51.2  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.3 
 
 		 864 aa  50.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.34 
 
 		 281 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  38 
 
 		 814 aa  50.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  22.7 
 
 		 1017 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  33.02 
 
 		 1172 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  28.43 
 
 		 221 aa  50.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  25.63 
 
 		 790 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.73 
 
 		 281 aa  50.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  28.57 
 
 		 1116 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  33.02 
 
 		 1172 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  27.41 
 
 		 859 aa  49.3  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.02 
 
 		 278 aa  48.9  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.67 
 
 		 278 aa  48.9  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  30.93 
 
 		 829 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.45 
 
 		 1059 aa  47.8  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  27.78 
 
 		 1114 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  27.6 
 
 		 1032 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  31.33 
 
 		 1022 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  30.3 
 
 		 1074 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 805 aa  47.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  26.13 
 
 		 935 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  25.9 
 
 		 840 aa  47.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  21.92 
 
 		 859 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  28.97 
 
 		 1213 aa  47  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.82 
 
 		 281 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  31.33 
 
 		 1022 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1194  ATPase  41.1 
 
 		 212 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.157933  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  25.79 
 
 		 1025 aa  46.2  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  26.89 
 
 		 984 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  46.94 
 
 		 888 aa  45.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  20.62 
 
 		 702 aa  45.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  22.89 
 
 		 702 aa  45.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.11 
 
 		 1019 aa  44.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1020 aa  44.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  48.89 
 
 		 795 aa  45.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  37.68 
 
 		 950 aa  44.7  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07191  ABC transporter ATP-binding protein  35.8 
 
 		 215 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.30257  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  25.52 
 
 		 918 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  26.26 
 
 		 1214 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  32.63 
 
 		 514 aa  44.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  25.25 
 
 		 1214 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 		 1172 aa  44.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  22.16 
 
 		 3060 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 922 aa  44.3  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  23.4 
 
 		 1033 aa  44.3  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>