More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1194 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1194  ATPase  100 
 
 
212 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.157933  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1283  ATPase  72.51 
 
 
212 aa  309  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14231  ABC transporter ATP-binding protein  65.37 
 
 
210 aa  264  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07791  ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
210 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.734728  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0098  ABC transporter ATP-binding protein  55.61 
 
 
208 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07231  ABC transporter ATP-binding protein  55.61 
 
 
208 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391704 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07191  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
215 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.30257  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07211  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
215 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0666  ABC transporter ATP-binding protein  50.48 
 
 
215 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.775453  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07391  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
215 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1682  ABC transporter-like protein protein  50 
 
 
223 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4987  ABC transporter-like  49.46 
 
 
224 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0560  ATPase  50.27 
 
 
234 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.536031  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0877  ABC transporter related  46.92 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2565  ABC transporter related  48.39 
 
 
224 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814062  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1032  ABC transporter related  47.39 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1061  ABC transporter related  45.93 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956591  hitchhiker  0.004638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3746  ABC transporter related  47.31 
 
 
217 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6452  ABC(ATP-binding) family transporter: cobalt ion  42.65 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.96 
 
 
278 aa  115  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1750  ABC transporter related  31.94 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.465278  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.58 
 
 
310 aa  112  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1272  ABC transporter related  36.56 
 
 
224 aa  111  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 
489 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  32.88 
 
 
398 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  36.81 
 
 
493 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  34.33 
 
 
493 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.38 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  33.01 
 
 
288 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  34.98 
 
 
256 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  40.88 
 
 
246 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.95 
 
 
281 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.43 
 
 
278 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  36.57 
 
 
289 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  39.02 
 
 
247 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.8 
 
 
305 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.08 
 
 
395 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  41.62 
 
 
255 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  34.83 
 
 
243 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.89 
 
 
286 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  35.1 
 
 
221 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  37.81 
 
 
283 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.16 
 
 
403 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 
440 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  34.83 
 
 
243 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.19 
 
 
810 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  33.03 
 
 
247 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  32.59 
 
 
221 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2106  ABC transporter related  35.38 
 
 
248 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.61282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.24 
 
 
247 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  37.3 
 
 
257 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  34.23 
 
 
234 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  31.36 
 
 
283 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1504  ABC transporter related  29.77 
 
 
268 aa  102  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  31.36 
 
 
283 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  34.23 
 
 
234 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  34.92 
 
 
476 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  35.78 
 
 
206 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.5 
 
 
248 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.16 
 
 
288 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.61 
 
 
244 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.09 
 
 
271 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  34.23 
 
 
234 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  36.28 
 
 
206 aa  102  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0779  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
248 aa  101  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  34.87 
 
 
251 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1141  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
213 aa  101  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  37.06 
 
 
244 aa  101  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  36.54 
 
 
242 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.81 
 
 
252 aa  101  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 
221 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  32.72 
 
 
242 aa  101  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
244 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  33.03 
 
 
249 aa  101  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.63 
 
 
647 aa  101  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.84 
 
 
502 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  33.53 
 
 
470 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
467 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  35.48 
 
 
242 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.56 
 
 
252 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  34.72 
 
 
247 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
254 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0210  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
248 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.770881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  35.48 
 
 
242 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  37.68 
 
 
222 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  35.81 
 
 
249 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
675 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  34.97 
 
 
628 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  35.92 
 
 
243 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0257  ATP-binding protein  33.65 
 
 
248 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000197314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.97 
 
 
247 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  41.33 
 
 
249 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  32.27 
 
 
291 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  33.8 
 
 
247 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  33.18 
 
 
234 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  36.06 
 
 
242 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
244 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  40.33 
 
 
246 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2248  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.64 
 
 
286 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  33.64 
 
 
233 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>