187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1574 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 840 aa  1595    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  38.92 
 
 		 618 aa  126  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  36.21 
 
 		 978 aa  124  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.67 
 
 		 935 aa  77.4  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  24.45 
 
 		 891 aa  77  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.46 
 
 		 864 aa  73.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  32.29 
 
 		 1061 aa  72.4  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.28 
 
 		 858 aa  69.7  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.81 
 
 		 1031 aa  69.3  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  25.29 
 
 		 1019 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  30.53 
 
 		 1057 aa  68.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.42 
 
 		 789 aa  68.2  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  27.69 
 
 		 1190 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  29.94 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  28.57 
 
 		 953 aa  65.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 993 aa  65.1  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  29.33 
 
 		 812 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  23.31 
 
 		 1346 aa  64.3  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.15 
 
 		 993 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  25.42 
 
 		 1224 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  27.62 
 
 		 857 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 993 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  26.17 
 
 		 994 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  25 
 
 		 895 aa  63.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  23 
 
 		 1226 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  27.42 
 
 		 890 aa  62  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  25.96 
 
 		 910 aa  61.6  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  22.46 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3265  DNA repair ATPase-like protein  25.58 
 
 		 757 aa  61.2  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  25.31 
 
 		 1017 aa  60.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  25.38 
 
 		 1226 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.09 
 
 		 922 aa  60.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  22.37 
 
 		 1085 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.83 
 
 		 1019 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  22.79 
 
 		 1226 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  25.51 
 
 		 1180 aa  60.1  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  26.14 
 
 		 924 aa  60.1  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  22.03 
 
 		 1234 aa  60.1  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  26.6 
 
 		 1114 aa  60.1  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  23.04 
 
 		 824 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  23.13 
 
 		 1227 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  23.76 
 
 		 1165 aa  59.3  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  22.6 
 
 		 1219 aa  58.9  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  25.62 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  28.08 
 
 		 804 aa  58.5  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  23.22 
 
 		 1018 aa  58.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  25.81 
 
 		 1198 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  23.46 
 
 		 1088 aa  58.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  26.83 
 
 		 1013 aa  58.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  22.22 
 
 		 1238 aa  58.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  18.97 
 
 		 1307 aa  57.4  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  26.1 
 
 		 1020 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  26.78 
 
 		 862 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  19.43 
 
 		 1303 aa  57.4  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  26.99 
 
 		 1018 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  24.74 
 
 		 1038 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  22.93 
 
 		 1155 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  25.84 
 
 		 1103 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  24.23 
 
 		 1223 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  28.43 
 
 		 1046 aa  56.6  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  25.61 
 
 		 1182 aa  56.2  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  24.39 
 
 		 1074 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  22.73 
 
 		 1232 aa  55.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.08 
 
 		 859 aa  55.1  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  23.9 
 
 		 1172 aa  55.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  23.9 
 
 		 1172 aa  55.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.19 
 
 		 1219 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  21.55 
 
 		 1091 aa  55.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.37 
 
 		 1018 aa  55.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  24.21 
 
 		 891 aa  55.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  21.51 
 
 		 810 aa  55.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  21.85 
 
 		 926 aa  54.7  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  25 
 
 		 1099 aa  54.7  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  25.12 
 
 		 1164 aa  54.7  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  22.74 
 
 		 961 aa  53.9  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 		 1146 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  23.06 
 
 		 1039 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  21.79 
 
 		 1223 aa  53.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  24.36 
 
 		 904 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 		 1018 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  21.69 
 
 		 1029 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  23.45 
 
 		 1308 aa  52.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  22.48 
 
 		 1023 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  27.5 
 
 		 1021 aa  52.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  28.04 
 
 		 995 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  28.57 
 
 		 1006 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.42 
 
 		 1201 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  25.08 
 
 		 852 aa  52.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  21.89 
 
 		 690 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  22.67 
 
 		 1226 aa  52  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  35.25 
 
 		 917 aa  52  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  23.08 
 
 		 859 aa  51.6  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.41 
 
 		 1189 aa  51.6  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  22.42 
 
 		 1008 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  23.51 
 
 		 1146 aa  51.2  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  24.67 
 
 		 1020 aa  51.6  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.41 
 
 		 1189 aa  51.6  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  26.01 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04706  myosin II homolog (Eurofung)  28.12 
 
 		 2404 aa  50.8  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  24.07 
 
 		 1016 aa  50.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>