251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2009 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 922 aa  1773    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  39.14 
 
 		 912 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  27.46 
 
 		 1021 aa  253  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  18.77 
 
 		 993 aa  138  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  18.83 
 
 		 993 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  18.63 
 
 		 994 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.21 
 
 		 935 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  18.94 
 
 		 993 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  30.5 
 
 		 813 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  34.83 
 
 		 814 aa  106  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  29.52 
 
 		 987 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  21.28 
 
 		 858 aa  99.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  26.91 
 
 		 987 aa  91.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  22.76 
 
 		 804 aa  86.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.57 
 
 		 891 aa  75.9  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  26.1 
 
 		 984 aa  71.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  24.77 
 
 		 1019 aa  71.2  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  29.64 
 
 		 1308 aa  68.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  24.09 
 
 		 1007 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  58.7 
 
 		 702 aa  65.5  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  19.4 
 
 		 952 aa  65.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  63.04 
 
 		 702 aa  65.1  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  43.24 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  37.18 
 
 		 864 aa  63.9  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  26.64 
 
 		 859 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  24.01 
 
 		 895 aa  64.3  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  28.76 
 
 		 1223 aa  62.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  20.81 
 
 		 1319 aa  62.4  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  22.94 
 
 		 1179 aa  62.4  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  37.78 
 
 		 1306 aa  62.4  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  56.52 
 
 		 702 aa  62  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  23.22 
 
 		 924 aa  61.6  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  25.27 
 
 		 1182 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.06 
 
 		 1187 aa  59.3  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  52.17 
 
 		 700 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  21.12 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  57.78 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  21.46 
 
 		 926 aa  58.5  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  26.19 
 
 		 1008 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  26.19 
 
 		 1008 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  51.11 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  27.23 
 
 		 1195 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  21.88 
 
 		 1061 aa  57.4  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  27.4 
 
 		 1227 aa  57.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.76 
 
 		 961 aa  56.6  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.65 
 
 		 851 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  25.53 
 
 		 1205 aa  57  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  27.23 
 
 		 1222 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  28.87 
 
 		 1303 aa  56.2  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  21.49 
 
 		 1179 aa  55.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  38.36 
 
 		 639 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 		 1255 aa  55.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  28.45 
 
 		 1307 aa  55.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  29.47 
 
 		 1091 aa  55.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 		 859 aa  55.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.4 
 
 		 1177 aa  55.5  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  30.61 
 
 		 693 aa  55.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 353 aa  55.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 		 1217 aa  55.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  28.45 
 
 		 1229 aa  55.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  27.88 
 
 		 1019 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  28.45 
 
 		 1229 aa  55.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  22.84 
 
 		 1074 aa  54.7  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  39.74 
 
 		 358 aa  54.7  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  24.47 
 
 		 1195 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  24.47 
 
 		 1195 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  24.47 
 
 		 1195 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 1192 aa  54.7  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  18.25 
 
 		 1174 aa  53.9  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1214 aa  54.3  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  24.83 
 
 		 1224 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 		 1191 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  43.75 
 
 		 1318 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  43.75 
 
 		 1280 aa  54.3  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  23.95 
 
 		 1031 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  24.34 
 
 		 1187 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  27.12 
 
 		 1346 aa  54.3  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  23.41 
 
 		 1172 aa  54.3  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01100  telomere maintenance protein, putative  32.08 
 
 		 1289 aa  53.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28116  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  22.61 
 
 		 1125 aa  53.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  43.75 
 
 		 1307 aa  53.5  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  23.72 
 
 		 1173 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  26.7 
 
 		 1213 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  24.85 
 
 		 1177 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  26.21 
 
 		 1184 aa  53.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  20.96 
 
 		 1049 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  25.4 
 
 		 1137 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  26.29 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  26.84 
 
 		 1234 aa  53.5  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  23.16 
 
 		 1196 aa  53.5  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  27.59 
 
 		 1023 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  21.58 
 
 		 1177 aa  52.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 		 1194 aa  52.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  23.25 
 
 		 1187 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  39.58 
 
 		 1115 aa  52.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  29.19 
 
 		 1226 aa  52.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  24.83 
 
 		 890 aa  52.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  23.94 
 
 		 1194 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  23.18 
 
 		 1218 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  20.81 
 
 		 852 aa  53.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>