More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2437 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  50.38 
 
 
891 aa  787    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  51.78 
 
 
890 aa  758    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  100 
 
 
924 aa  1783    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  49.46 
 
 
902 aa  693    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  70.42 
 
 
895 aa  1133    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  31.33 
 
 
888 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  29.56 
 
 
926 aa  296  8e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  36.51 
 
 
1074 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  21.87 
 
 
891 aa  151  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.01 
 
 
858 aa  137  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.19 
 
 
864 aa  134  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  22.78 
 
 
859 aa  104  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  28.94 
 
 
1061 aa  102  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  27.15 
 
 
993 aa  101  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 
994 aa  99.4  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  24.34 
 
 
993 aa  98.2  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  26.6 
 
 
993 aa  96.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  31.84 
 
 
1007 aa  95.9  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  33.17 
 
 
1003 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  31.43 
 
 
1016 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  25.66 
 
 
802 aa  92  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  27.84 
 
 
1019 aa  91.7  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  32.16 
 
 
1007 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  28.53 
 
 
1022 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  27.04 
 
 
804 aa  88.2  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  29.21 
 
 
851 aa  87.8  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  28.79 
 
 
1023 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  29.65 
 
 
1038 aa  87.4  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  31.33 
 
 
789 aa  87  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  26.19 
 
 
702 aa  84.7  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  23.74 
 
 
859 aa  84.3  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  25.13 
 
 
984 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  30.56 
 
 
1008 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  30.06 
 
 
1019 aa  82  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.59 
 
 
1189 aa  81.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  29.35 
 
 
702 aa  81.3  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  25.98 
 
 
1108 aa  80.5  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  35.37 
 
 
618 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  26.1 
 
 
1189 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  28.48 
 
 
852 aa  79.7  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  28.48 
 
 
852 aa  79.7  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.4 
 
 
935 aa  79.3  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  31.31 
 
 
955 aa  79  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  25.85 
 
 
1172 aa  76.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  26.74 
 
 
950 aa  77  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  26.64 
 
 
987 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 
1189 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.72 
 
 
1057 aa  77  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  24.1 
 
 
812 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  23.34 
 
 
978 aa  75.5  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  22.4 
 
 
1021 aa  75.1  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 
1153 aa  74.7  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25.28 
 
 
693 aa  74.7  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  28.11 
 
 
862 aa  74.3  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  26.88 
 
 
1151 aa  73.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  24.73 
 
 
1191 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  28.48 
 
 
815 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  23.67 
 
 
906 aa  72.4  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  26.26 
 
 
987 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  25.27 
 
 
1189 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  26.54 
 
 
702 aa  71.6  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  29.8 
 
 
824 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  27.09 
 
 
824 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  24 
 
 
790 aa  68.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  27.75 
 
 
1099 aa  68.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  28.98 
 
 
989 aa  68.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  23.95 
 
 
1180 aa  68.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  24.73 
 
 
794 aa  68.2  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  30.59 
 
 
1167 aa  68.2  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.46 
 
 
1174 aa  68.2  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  26.7 
 
 
1153 aa  67.8  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1150 aa  67.8  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 
1140 aa  67.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  31.43 
 
 
910 aa  67.4  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  29.67 
 
 
1151 aa  66.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  27.13 
 
 
1081 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  23.6 
 
 
1039 aa  65.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 
1153 aa  66.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.88 
 
 
784 aa  66.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.67 
 
 
1207 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.27 
 
 
1134 aa  65.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  31.02 
 
 
1151 aa  65.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  28.89 
 
 
1154 aa  65.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 
1171 aa  65.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  28.49 
 
 
1234 aa  65.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  21.68 
 
 
857 aa  65.1  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.18 
 
 
1201 aa  65.1  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  24.39 
 
 
829 aa  65.1  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  28.04 
 
 
1153 aa  64.7  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  28.05 
 
 
1151 aa  64.7  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  31.58 
 
 
1153 aa  64.7  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.46 
 
 
1116 aa  64.7  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  29.83 
 
 
1144 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  24.28 
 
 
1049 aa  64.3  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  26.44 
 
 
1081 aa  63.9  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 
1167 aa  63.9  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  21.28 
 
 
1030 aa  63.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 
1146 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  29.26 
 
 
1148 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  29.95 
 
 
1170 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>