195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0748 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  100 
 
 
935 aa  1811    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.72 
 
 
813 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  21.83 
 
 
912 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  23.14 
 
 
984 aa  155  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.23 
 
 
1021 aa  147  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  22.14 
 
 
814 aa  134  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  27.14 
 
 
891 aa  125  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24.62 
 
 
858 aa  112  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  22.81 
 
 
987 aa  111  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  27.87 
 
 
993 aa  108  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  21.71 
 
 
987 aa  108  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  26.02 
 
 
702 aa  93.2  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  28.53 
 
 
693 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  21.76 
 
 
1023 aa  85.1  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.75 
 
 
859 aa  83.2  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  30.54 
 
 
994 aa  82.4  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  22.99 
 
 
700 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  27.96 
 
 
864 aa  79.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.14 
 
 
702 aa  79.3  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  20.21 
 
 
1031 aa  78.2  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  22.72 
 
 
1116 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  22.3 
 
 
1009 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  28.5 
 
 
1019 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  22.06 
 
 
1214 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  24.57 
 
 
789 aa  76.3  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.68 
 
 
804 aa  75.1  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  24.58 
 
 
902 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  24.02 
 
 
922 aa  72.8  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.81 
 
 
926 aa  71.6  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.8 
 
 
702 aa  71.6  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  23.45 
 
 
924 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 
993 aa  68.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  21.27 
 
 
892 aa  68.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  22.29 
 
 
859 aa  67  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  21.44 
 
 
890 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  22.21 
 
 
1061 aa  67  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  22.75 
 
 
1016 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  24.22 
 
 
1125 aa  65.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  26.98 
 
 
1013 aa  63.9  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  23.01 
 
 
1214 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  27.81 
 
 
812 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  22.33 
 
 
895 aa  63.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  23.88 
 
 
1018 aa  62  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  48.53 
 
 
993 aa  62  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  20.62 
 
 
1024 aa  61.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25 
 
 
1114 aa  61.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  21.92 
 
 
1049 aa  60.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  19.74 
 
 
1019 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  27.81 
 
 
953 aa  60.1  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  25.26 
 
 
1039 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  26.7 
 
 
857 aa  60.1  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  27.37 
 
 
840 aa  59.7  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  25.38 
 
 
859 aa  59.3  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  21.97 
 
 
891 aa  58.9  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  24.84 
 
 
852 aa  58.9  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  23.2 
 
 
830 aa  58.5  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  22.12 
 
 
1003 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  41.33 
 
 
1436 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  25.38 
 
 
1234 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  23.16 
 
 
445 aa  57.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  24.62 
 
 
805 aa  57.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  21.76 
 
 
1244 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  22.35 
 
 
1214 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  24.45 
 
 
1008 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  25.93 
 
 
1046 aa  56.6  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  22.68 
 
 
1020 aa  57  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  23 
 
 
1172 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  21.61 
 
 
1029 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  22.25 
 
 
1018 aa  56.2  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  23.09 
 
 
1063 aa  55.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  27.38 
 
 
978 aa  55.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  22.5 
 
 
1172 aa  55.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  41.89 
 
 
1319 aa  55.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  28.08 
 
 
712 aa  55.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  34.34 
 
 
852 aa  55.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  26.06 
 
 
1180 aa  55.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  22.04 
 
 
1146 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  24.88 
 
 
802 aa  55.1  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  23.8 
 
 
1181 aa  54.7  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  22.97 
 
 
1029 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  22.61 
 
 
1029 aa  54.7  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  33.33 
 
 
1099 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  23.81 
 
 
1213 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  21.38 
 
 
784 aa  53.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  31.71 
 
 
483 aa  53.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  23.66 
 
 
1214 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  21.06 
 
 
1018 aa  53.5  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  23.78 
 
 
1029 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  25.27 
 
 
1169 aa  52.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  24.62 
 
 
1007 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  23.9 
 
 
1029 aa  52.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  25.27 
 
 
1169 aa  52.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  22.52 
 
 
1022 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  23.58 
 
 
1214 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  25.22 
 
 
1038 aa  52.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  25 
 
 
888 aa  52.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  23.08 
 
 
1018 aa  52.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  24.06 
 
 
1179 aa  52  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.01 
 
 
1074 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.6 
 
 
961 aa  52  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>