95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0696 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  100 
 
 		 618 aa  1250    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  46.41 
 
 		 978 aa  156  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  38.92 
 
 		 840 aa  126  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  34.68 
 
 		 924 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  31.31 
 
 		 902 aa  77  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  28.51 
 
 		 1007 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  26.16 
 
 		 1016 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  31.79 
 
 		 895 aa  68.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  30.32 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  25.79 
 
 		 1007 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  29.1 
 
 		 922 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  25.4 
 
 		 891 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  26.1 
 
 		 1031 aa  63.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  29.31 
 
 		 1108 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  27.61 
 
 		 922 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  25.57 
 
 		 1008 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  28.11 
 
 		 955 aa  60.8  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  29.14 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  24.57 
 
 		 829 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  31.53 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3265  DNA repair ATPase-like protein  27.59 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  31.29 
 
 		 910 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  28.32 
 
 		 1057 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  24.88 
 
 		 993 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  23.81 
 
 		 993 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  24.88 
 
 		 993 aa  54.3  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  28.41 
 
 		 1061 aa  53.9  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  28.16 
 
 		 890 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  26.11 
 
 		 953 aa  52.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.8 
 
 		 904 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.65 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  31.41 
 
 		 1180 aa  51.2  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  27.37 
 
 		 1003 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  24.23 
 
 		 1019 aa  51.2  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  27.17 
 
 		 1049 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.19 
 
 		 1019 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 		 1023 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 852 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.23 
 
 		 994 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 852 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.39 
 
 		 961 aa  50.4  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  27.08 
 
 		 1008 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  27.72 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 804 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.08 
 
 		 1008 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  30.49 
 
 		 700 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  26.29 
 
 		 1116 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  31.03 
 
 		 864 aa  48.9  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  31.71 
 
 		 702 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  24.64 
 
 		 883 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.83 
 
 		 859 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  26.13 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  25.15 
 
 		 995 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  28.7 
 
 		 891 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  26.59 
 
 		 851 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  27.7 
 
 		 1006 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  32.99 
 
 		 858 aa  47.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  27.66 
 
 		 814 aa  47.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  43.18 
 
 		 885 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  25.11 
 
 		 1174 aa  47  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  32.28 
 
 		 724 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  25.14 
 
 		 1046 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25.56 
 
 		 1114 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  25 
 
 		 857 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  25.64 
 
 		 683 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 859 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1157 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  24.62 
 
 		 1013 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  29.41 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  25.51 
 
 		 1307 aa  46.2  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  25.79 
 
 		 711 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  25.35 
 
 		 859 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  25.32 
 
 		 1303 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  40.3 
 
 		 581 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  26.67 
 
 		 1022 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.5 
 
 		 906 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  47.83 
 
 		 368 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  27.59 
 
 		 234 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1051 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  24.65 
 
 		 1265 aa  45.8  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1768  ABC transporter related  28.49 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  23.56 
 
 		 1018 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25.79 
 
 		 693 aa  44.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  25.95 
 
 		 361 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  25.95 
 
 		 361 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  34.52 
 
 		 765 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  23.56 
 
 		 1018 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  24.29 
 
 		 1226 aa  44.3  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  32.88 
 
 		 1191 aa  44.3  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  24.4 
 
 		 1047 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  27.1 
 
 		 1172 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1185 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  30.37 
 
 		 987 aa  43.9  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  28.42 
 
 		 514 aa  43.5  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  27.1 
 
 		 1172 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>