More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0237 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  58.22 
 
 		 1019 aa  1010    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  83.28 
 
 		 993 aa  1531    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  84.59 
 
 		 993 aa  1543    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 993 aa  1892    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  40.04 
 
 		 994 aa  567  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  28.2 
 
 		 891 aa  179  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  26.96 
 
 		 864 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  30.22 
 
 		 858 aa  109  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  23.04 
 
 		 891 aa  107  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.87 
 
 		 1074 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  35.76 
 
 		 789 aa  101  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  18.61 
 
 		 1031 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  27.17 
 
 		 888 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  25.48 
 
 		 895 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  23.49 
 
 		 1021 aa  99.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  26.6 
 
 		 902 aa  99.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  29.9 
 
 		 926 aa  99.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.09 
 
 		 924 aa  97.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  20.96 
 
 		 1019 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.92 
 
 		 1057 aa  93.2  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  28.42 
 
 		 910 aa  92  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  27.87 
 
 		 935 aa  92  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 693 aa  91.7  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  19.79 
 
 		 906 aa  90.1  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  25.1 
 
 		 1061 aa  89.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  26.09 
 
 		 702 aa  88.6  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  33.16 
 
 		 812 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  28.14 
 
 		 955 aa  86.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  28.63 
 
 		 859 aa  84  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  29.83 
 
 		 859 aa  82.4  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  26.94 
 
 		 859 aa  81.6  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  31.49 
 
 		 857 aa  81.6  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  27.32 
 
 		 1016 aa  81.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  26.9 
 
 		 1007 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  25.29 
 
 		 702 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  23.07 
 
 		 1008 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  23.07 
 
 		 1008 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  30.68 
 
 		 1232 aa  77.4  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  31.15 
 
 		 1234 aa  77.4  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  20.11 
 
 		 1008 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  28.42 
 
 		 804 aa  75.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  23.49 
 
 		 1188 aa  75.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  22.78 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  28.96 
 
 		 1226 aa  74.7  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  28.07 
 
 		 702 aa  75.1  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  26.96 
 
 		 1308 aa  74.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  24.17 
 
 		 814 aa  74.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  24.02 
 
 		 1232 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  25.86 
 
 		 1022 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  30.91 
 
 		 852 aa  73.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  30.91 
 
 		 852 aa  74.3  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  29.1 
 
 		 802 aa  72.4  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  24.2 
 
 		 1009 aa  71.6  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  25.43 
 
 		 1003 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  24.68 
 
 		 805 aa  71.2  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  30.81 
 
 		 961 aa  71.2  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  34.09 
 
 		 806 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.34 
 
 		 904 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  26.04 
 
 		 1189 aa  69.7  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  27.93 
 
 		 1049 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  27 
 
 		 1022 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  24.02 
 
 		 912 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  29.41 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1184 aa  68.9  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.39 
 
 		 1029 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  25.74 
 
 		 1196 aa  68.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  30.29 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  24.06 
 
 		 810 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  23.49 
 
 		 984 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  25.16 
 
 		 1227 aa  67  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  23.4 
 
 		 700 aa  67  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  22.02 
 
 		 1247 aa  66.6  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  24.89 
 
 		 1047 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  26.26 
 
 		 1238 aa  66.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  26.59 
 
 		 1029 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  24.43 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  27.22 
 
 		 1303 aa  65.9  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  24.43 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  24.43 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  24.43 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  23.24 
 
 		 953 aa  65.5  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  27.22 
 
 		 1307 aa  65.5  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  27.27 
 
 		 1265 aa  65.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  26.46 
 
 		 890 aa  65.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  24.43 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  24.43 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.53 
 
 		 813 aa  64.7  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  25.79 
 
 		 1042 aa  64.7  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  25.73 
 
 		 1047 aa  64.7  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  26.88 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  26.43 
 
 		 978 aa  63.9  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  25.37 
 
 		 824 aa  64.3  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  27.59 
 
 		 1116 aa  63.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28 
 
 		 1134 aa  63.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 		 1185 aa  63.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  25.62 
 
 		 1103 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  24.46 
 
 		 824 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 		 840 aa  63.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  32.56 
 
 		 664 aa  63.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>