More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0711 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 994 aa  1892    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  40.3 
 
 		 993 aa  592  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  38.39 
 
 		 993 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  39.03 
 
 		 993 aa  552  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  38.17 
 
 		 1019 aa  522  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  22.87 
 
 		 858 aa  180  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  25.02 
 
 		 864 aa  171  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  30.61 
 
 		 891 aa  145  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  23.33 
 
 		 1021 aa  140  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  20.69 
 
 		 1061 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  20.67 
 
 		 1031 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  22.47 
 
 		 1016 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  19.53 
 
 		 1019 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  25.89 
 
 		 935 aa  112  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  24.72 
 
 		 891 aa  110  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  25 
 
 		 924 aa  105  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  30.7 
 
 		 1074 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  26.32 
 
 		 895 aa  104  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  31.55 
 
 		 789 aa  102  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  31.84 
 
 		 888 aa  101  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  20.17 
 
 		 984 aa  100  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  20.35 
 
 		 1057 aa  98.2  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  28.96 
 
 		 1007 aa  95.5  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  23.16 
 
 		 890 aa  94  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  31.22 
 
 		 859 aa  92  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  28.48 
 
 		 910 aa  91.3  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  30.16 
 
 		 859 aa  89.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  28.5 
 
 		 1003 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  30.16 
 
 		 859 aa  89.7  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  19.43 
 
 		 926 aa  89  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  31.06 
 
 		 961 aa  88.6  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  28.73 
 
 		 857 aa  87.8  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  20.42 
 
 		 1008 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25.69 
 
 		 902 aa  86.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 		 693 aa  85.1  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  33.13 
 
 		 812 aa  84.7  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.42 
 
 		 804 aa  83.2  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  22.39 
 
 		 852 aa  82.8  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  22.39 
 
 		 852 aa  82.8  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  21.03 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  19.14 
 
 		 1022 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  27.04 
 
 		 1022 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  26.32 
 
 		 912 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  28.57 
 
 		 1007 aa  79.3  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  28.57 
 
 		 1008 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  33.81 
 
 		 906 aa  78.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  28.11 
 
 		 1008 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  26.9 
 
 		 955 aa  77.4  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  28.21 
 
 		 904 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  25.64 
 
 		 802 aa  76.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  29.74 
 
 		 1114 aa  75.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.24 
 
 		 851 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  23.76 
 
 		 987 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  27.46 
 
 		 1023 aa  75.5  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  27.81 
 
 		 1039 aa  75.1  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  20.91 
 
 		 1018 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  23.38 
 
 		 1009 aa  74.3  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  27.82 
 
 		 987 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.26 
 
 		 702 aa  74.3  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  24.33 
 
 		 483 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.31 
 
 		 1180 aa  73.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  32.47 
 
 		 806 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  25.93 
 
 		 1025 aa  73.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.63 
 
 		 1108 aa  72.8  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  20.95 
 
 		 1033 aa  72.4  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  21.27 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  20.49 
 
 		 1134 aa  72  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  20.04 
 
 		 1023 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  27.75 
 
 		 1234 aa  70.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.31 
 
 		 813 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 		 700 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  24.32 
 
 		 1011 aa  69.3  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  34.55 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  27.17 
 
 		 922 aa  68.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  30.32 
 
 		 1247 aa  67.4  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  21.74 
 
 		 1029 aa  67.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  27.33 
 
 		 1172 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  27.33 
 
 		 1172 aa  66.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  22.59 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  28.82 
 
 		 1116 aa  65.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.86 
 
 		 1030 aa  65.5  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  29.95 
 
 		 1226 aa  65.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.22 
 
 		 1038 aa  65.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  36.27 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  28.21 
 
 		 1238 aa  64.7  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  26.5 
 
 		 1185 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  26.2 
 
 		 1223 aa  64.3  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.18 
 
 		 1184 aa  64.3  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  21.62 
 
 		 1165 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.14 
 
 		 1174 aa  63.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  26.5 
 
 		 1185 aa  63.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.45 
 
 		 1179 aa  62.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  29.51 
 
 		 952 aa  62.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  25 
 
 		 1308 aa  62.4  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  25.62 
 
 		 840 aa  62.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  24.53 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  21.75 
 
 		 1174 aa  62  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  27.23 
 
 		 1191 aa  62  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  25.29 
 
 		 1227 aa  62  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  23.95 
 
 		 953 aa  61.6  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>