175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01100 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN01100  telomere maintenance protein, putative  100 
 
 
1289 aa  2625    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28116  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  33.69 
 
 
1319 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  30.13 
 
 
1313 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  36.35 
 
 
1306 aa  278  3e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  43.69 
 
 
1436 aa  221  8.999999999999998e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  43.84 
 
 
891 aa  58.5  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  33 
 
 
864 aa  52.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.4 
 
 
858 aa  52.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  29.6 
 
 
693 aa  52.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  30 
 
 
641 aa  51.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  40 
 
 
535 aa  51.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  37.96 
 
 
615 aa  51.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 
553 aa  51.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 
555 aa  50.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl096  oligopeptide ABC transporter ATP-binding component  30.91 
 
 
522 aa  49.3  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 
553 aa  49.3  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1308  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  30.48 
 
 
385 aa  49.3  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 
553 aa  49.3  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  36.26 
 
 
635 aa  49.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 
553 aa  49.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  35.62 
 
 
984 aa  49.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0163  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.61 
 
 
566 aa  48.9  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 
242 aa  48.9  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 
242 aa  48.5  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 
242 aa  48.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0207  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
336 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.23 
 
 
336 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 
556 aa  47.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  42.11 
 
 
596 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  42.47 
 
 
628 aa  47.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1913  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 
554 aa  47  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2903  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
553 aa  47.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0207119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
608 aa  47  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04409  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 
553 aa  47  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.94 
 
 
560 aa  47.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0231  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 
336 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
642 aa  47.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  40 
 
 
642 aa  47.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  27.59 
 
 
649 aa  47.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  27.59 
 
 
649 aa  47.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 
554 aa  47.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3545  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.03 
 
 
327 aa  47.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.35 
 
 
339 aa  47  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1852  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 
554 aa  47  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.62 
 
 
630 aa  47  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1245  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 
553 aa  47  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2608  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
579 aa  47.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.234433  normal  0.107182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 
669 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.219449  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1200  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
553 aa  47.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1511  ABC transporter related  27.36 
 
 
246 aa  47  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 
579 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.56 
 
 
328 aa  47.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3556  ABC transporter related  34.57 
 
 
549 aa  47.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  29.2 
 
 
529 aa  46.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4210  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
345 aa  46.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
560 aa  47  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
560 aa  46.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 
553 aa  46.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 
578 aa  47  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 
670 aa  46.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  26.9 
 
 
661 aa  46.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  26.9 
 
 
661 aa  46.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  35.23 
 
 
548 aa  46.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  25.69 
 
 
258 aa  46.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 
555 aa  46.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0571  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 
554 aa  47  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.54 
 
 
555 aa  46.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  33.73 
 
 
560 aa  46.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.06 
 
 
555 aa  46.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
560 aa  46.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  25.69 
 
 
258 aa  46.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  37.5 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 
549 aa  46.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
558 aa  46.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  43.42 
 
 
244 aa  46.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
560 aa  46.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  30.09 
 
 
530 aa  46.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
560 aa  46.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2900  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
554 aa  46.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
544 aa  46.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
631 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
555 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0188  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.89 
 
 
336 aa  46.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
570 aa  46.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>