241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3179 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  40.73 
 
 		 1022 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1023 aa  2039    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  41.67 
 
 		 1022 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  37.32 
 
 		 1031 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  33.18 
 
 		 1008 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  31.5 
 
 		 1016 aa  429  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  33.17 
 
 		 1019 aa  416  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  30.02 
 
 		 1008 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  29.83 
 
 		 1008 aa  363  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  39.13 
 
 		 859 aa  271  4e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  37.47 
 
 		 859 aa  250  8e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  41.07 
 
 		 859 aa  244  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  33.64 
 
 		 1003 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  31.49 
 
 		 1007 aa  231  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  34.09 
 
 		 1007 aa  229  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  37.12 
 
 		 857 aa  178  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  19.45 
 
 		 994 aa  110  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  23.09 
 
 		 1061 aa  108  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  17.92 
 
 		 891 aa  102  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  20.99 
 
 		 993 aa  102  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  19.79 
 
 		 993 aa  98.2  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  31.02 
 
 		 910 aa  95.1  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  26.78 
 
 		 961 aa  93.2  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  31.15 
 
 		 890 aa  92.8  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  30.08 
 
 		 891 aa  92  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  32.99 
 
 		 904 aa  89.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.63 
 
 		 924 aa  87.4  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  28.31 
 
 		 906 aa  85.1  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  19.75 
 
 		 1009 aa  84.7  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  28.06 
 
 		 902 aa  84.7  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  34.31 
 
 		 1029 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  32.85 
 
 		 1029 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  32.85 
 
 		 1029 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  32.85 
 
 		 1029 aa  81.6  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  32.64 
 
 		 1029 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  32.85 
 
 		 1029 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  32.85 
 
 		 1029 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  27.36 
 
 		 1029 aa  81.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  32.85 
 
 		 1029 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  32.85 
 
 		 1029 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  32.12 
 
 		 1029 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  32.12 
 
 		 1029 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.76 
 
 		 935 aa  79.3  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  30.65 
 
 		 895 aa  78.6  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30.11 
 
 		 851 aa  77.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.98 
 
 		 1030 aa  76.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  23.05 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  29.08 
 
 		 810 aa  75.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  27.01 
 
 		 1099 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  28.64 
 
 		 824 aa  74.7  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  25.27 
 
 		 881 aa  74.3  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 1234 aa  72.4  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25 
 
 		 978 aa  71.6  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1637  putative DNA repair ATPase  24.83 
 
 		 774 aa  71.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5278  hypothetical protein  24.83 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366308  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  26.67 
 
 		 815 aa  71.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  28.68 
 
 		 1020 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  32.38 
 
 		 1214 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  31.43 
 
 		 1213 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  29.12 
 
 		 1000 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  32.38 
 
 		 1214 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  32.38 
 
 		 1214 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  25.38 
 
 		 1214 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  27.14 
 
 		 1018 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  31.43 
 
 		 1211 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  23.79 
 
 		 638 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  31.43 
 
 		 1211 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  31.43 
 
 		 1214 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 		 1232 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  26.52 
 
 		 953 aa  68.6  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  31.43 
 
 		 1214 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  31.93 
 
 		 1018 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  31.93 
 
 		 1018 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  31.93 
 
 		 1018 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  31.93 
 
 		 1018 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  25.67 
 
 		 1032 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.75 
 
 		 1219 aa  67.8  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  28.44 
 
 		 1165 aa  67.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  27.65 
 
 		 852 aa  67.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  29.26 
 
 		 1042 aa  67.4  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  31.93 
 
 		 1018 aa  67.4  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  27.65 
 
 		 852 aa  67.4  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  28 
 
 		 824 aa  67  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  32.77 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  32.77 
 
 		 1018 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  32.77 
 
 		 1018 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  26.74 
 
 		 1018 aa  66.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  27.57 
 
 		 950 aa  66.2  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  29.21 
 
 		 955 aa  65.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  28.93 
 
 		 1103 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  31.47 
 
 		 1081 aa  65.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  25.49 
 
 		 1039 aa  65.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.57 
 
 		 1013 aa  65.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  31.93 
 
 		 1018 aa  65.1  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  25.77 
 
 		 1232 aa  65.1  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 1230 aa  65.1  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 693 aa  64.7  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  23.59 
 
 		 1226 aa  64.7  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  29.44 
 
 		 1180 aa  64.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.98 
 
 		 1074 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>