More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1495 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  70.53 
 
 		 924 aa  1169    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  100 
 
 		 895 aa  1716    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  53.98 
 
 		 891 aa  833    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  52.07 
 
 		 902 aa  728    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  54.99 
 
 		 890 aa  792    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  32.39 
 
 		 888 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  29.59 
 
 		 926 aa  298  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  33.81 
 
 		 1074 aa  244  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.2 
 
 		 891 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.55 
 
 		 864 aa  151  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  21.62 
 
 		 994 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.99 
 
 		 804 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.37 
 
 		 858 aa  136  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  24.81 
 
 		 1008 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  22.09 
 
 		 993 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  22.53 
 
 		 993 aa  104  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.3 
 
 		 993 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  32.19 
 
 		 1016 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.25 
 
 		 1061 aa  100  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  21.71 
 
 		 789 aa  100  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  28.98 
 
 		 1019 aa  98.2  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  32.85 
 
 		 1007 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  24.12 
 
 		 862 aa  94.4  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  29.06 
 
 		 1038 aa  92.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  33.66 
 
 		 1003 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  26.55 
 
 		 1022 aa  91.3  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.53 
 
 		 935 aa  90.5  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  32.78 
 
 		 1007 aa  90.5  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  31.76 
 
 		 859 aa  89.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.7 
 
 		 1019 aa  87.8  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25.54 
 
 		 978 aa  87.8  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  25.66 
 
 		 802 aa  87.4  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  32.35 
 
 		 859 aa  85.9  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  36.2 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  31.17 
 
 		 851 aa  85.5  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  27.57 
 
 		 1031 aa  85.5  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.13 
 
 		 1008 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  28.07 
 
 		 702 aa  84.3  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  27.18 
 
 		 1108 aa  84  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  24.64 
 
 		 1008 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.95 
 
 		 1021 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.38 
 
 		 906 aa  81.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  29.09 
 
 		 852 aa  81.3  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  29.09 
 
 		 852 aa  81.3  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  26.69 
 
 		 984 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  27.91 
 
 		 950 aa  80.1  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  24.29 
 
 		 693 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  22.85 
 
 		 980 aa  78.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  27.43 
 
 		 1057 aa  78.2  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.39 
 
 		 813 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  23.92 
 
 		 953 aa  75.9  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  25.44 
 
 		 702 aa  75.1  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.31 
 
 		 1134 aa  75.1  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  21.72 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  22.34 
 
 		 961 aa  73.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  30.94 
 
 		 812 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  23.16 
 
 		 1189 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.63 
 
 		 1174 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  28.48 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  21.72 
 
 		 1039 aa  72.4  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  31.82 
 
 		 955 aa  72  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1485  SMC domain protein  21.41 
 
 		 952 aa  71.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  27.51 
 
 		 1151 aa  71.6  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  24.49 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  26.01 
 
 		 794 aa  70.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.19 
 
 		 1196 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 		 1169 aa  69.3  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  24.94 
 
 		 1169 aa  69.3  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  26.95 
 
 		 1148 aa  69.3  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  27.55 
 
 		 824 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  31.44 
 
 		 1167 aa  68.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4694  chromosome segregation protein SMC  31.55 
 
 		 1140 aa  68.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  32.32 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  21.08 
 
 		 857 aa  67.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  26.09 
 
 		 1154 aa  67.4  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.82 
 
 		 1201 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  26.11 
 
 		 1198 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  23.63 
 
 		 1174 aa  67  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  26.12 
 
 		 1196 aa  67  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  24.73 
 
 		 987 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.98 
 
 		 1189 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.44 
 
 		 1191 aa  65.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 		 1144 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  32.14 
 
 		 910 aa  65.1  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  23.31 
 
 		 1172 aa  65.1  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.34 
 
 		 1170 aa  65.1  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  27.93 
 
 		 1234 aa  65.1  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  28.25 
 
 		 1081 aa  64.7  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  27.55 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  29.19 
 
 		 1150 aa  64.7  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  22.02 
 
 		 1033 aa  64.3  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  31.98 
 
 		 989 aa  64.3  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  31.77 
 
 		 1153 aa  64.3  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1153 aa  64.3  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  21.75 
 
 		 1189 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  23.58 
 
 		 806 aa  63.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 1176 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 		 1148 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  21.77 
 
 		 1145 aa  63.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  24.41 
 
 		 1029 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>