More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0948 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  100 
 
 		 789 aa  1555    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  27.24 
 
 		 812 aa  193  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.46 
 
 		 1061 aa  127  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  30.86 
 
 		 1057 aa  114  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  24.38 
 
 		 859 aa  106  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  24.8 
 
 		 859 aa  105  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  28.88 
 
 		 955 aa  104  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  31.55 
 
 		 994 aa  102  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  35.76 
 
 		 993 aa  101  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  35.76 
 
 		 993 aa  101  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  35.76 
 
 		 993 aa  101  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  35.33 
 
 		 891 aa  96.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  32.83 
 
 		 1019 aa  92.8  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  31.33 
 
 		 924 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  33.33 
 
 		 891 aa  86.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  32.53 
 
 		 895 aa  85.1  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  32.82 
 
 		 1074 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  37.11 
 
 		 978 aa  82.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  29.14 
 
 		 829 aa  81.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  33.33 
 
 		 888 aa  80.9  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.59 
 
 		 902 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.57 
 
 		 935 aa  75.5  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  28.93 
 
 		 1016 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  27.66 
 
 		 1007 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  24.84 
 
 		 802 aa  71.2  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  25.24 
 
 		 702 aa  70.5  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.17 
 
 		 890 aa  68.9  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  27.18 
 
 		 1008 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  31.31 
 
 		 840 aa  68.2  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  30.32 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  29.07 
 
 		 1047 aa  67.8  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  29.17 
 
 		 859 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  34.42 
 
 		 852 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  34.42 
 
 		 852 aa  67  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  28.89 
 
 		 1007 aa  67  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.53 
 
 		 864 aa  66.6  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  26.67 
 
 		 1022 aa  66.6  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  26.63 
 
 		 1003 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  28.34 
 
 		 1022 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  26.53 
 
 		 1031 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  27.42 
 
 		 953 aa  65.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  39.78 
 
 		 857 aa  65.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  22.57 
 
 		 1022 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  26.63 
 
 		 926 aa  63.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  27.88 
 
 		 1172 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  27.88 
 
 		 1172 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  26.79 
 
 		 1185 aa  62.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  28.65 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.08 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  24.64 
 
 		 1247 aa  62.4  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  29.59 
 
 		 1180 aa  62.4  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  36.36 
 
 		 1023 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  31.49 
 
 		 1049 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  30.56 
 
 		 858 aa  61.2  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  29.84 
 
 		 1032 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  23.74 
 
 		 1081 aa  60.8  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  25.25 
 
 		 1009 aa  61.2  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  24.35 
 
 		 910 aa  60.8  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  26.74 
 
 		 1006 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  26.53 
 
 		 1308 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  27.45 
 
 		 1165 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.78 
 
 		 1009 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25.44 
 
 		 1198 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  27.59 
 
 		 806 aa  60.1  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  22.39 
 
 		 784 aa  60.1  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  29.25 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  27.21 
 
 		 917 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  30.63 
 
 		 1181 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  29.05 
 
 		 1038 aa  59.3  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.9 
 
 		 1019 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.41 
 
 		 1187 aa  59.3  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  25.14 
 
 		 1039 aa  58.9  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.26 
 
 		 1116 aa  58.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  22.8 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  26.4 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  24.9 
 
 		 1029 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  25.93 
 
 		 1029 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  25.68 
 
 		 1029 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  25.68 
 
 		 1029 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  25.82 
 
 		 1029 aa  57.4  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  25.82 
 
 		 1029 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  25.68 
 
 		 1029 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  25.82 
 
 		 1029 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  27.44 
 
 		 1186 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  25.68 
 
 		 1029 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  32.14 
 
 		 1179 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  29.46 
 
 		 1185 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  29.19 
 
 		 904 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  29.09 
 
 		 1046 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  32.14 
 
 		 1178 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  31.01 
 
 		 918 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  23.33 
 
 		 1025 aa  56.2  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  24.58 
 
 		 1029 aa  55.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  26.92 
 
 		 1020 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  25.32 
 
 		 912 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  24.56 
 
 		 1008 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  29.68 
 
 		 1114 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  23.68 
 
 		 693 aa  55.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  28.88 
 
 		 1108 aa  55.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  32.14 
 
 		 1178 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>