More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03960 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  100 
 
 		 1125 aa  2326    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  28.38 
 
 		 1146 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  27.94 
 
 		 1063 aa  327  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  25.91 
 
 		 1060 aa  285  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28237  predicted protein  40.85 
 
 		 220 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  24 
 
 		 1099 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  24.5 
 
 		 1076 aa  102  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08742  structural maintenance of chromosome complex subunit SmcA (AFU_orthologue; AFUA_6G02700)  21.59 
 
 		 1185 aa  77.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183997  normal  0.16607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  22.8 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  22.41 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.5 
 
 		 935 aa  67  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  22.81 
 
 		 1162 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 1188 aa  61.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  26.42 
 
 		 702 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  22.19 
 
 		 1173 aa  60.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  22.19 
 
 		 1162 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  28 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  35 
 
 		 864 aa  59.3  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  22.81 
 
 		 1162 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  26.35 
 
 		 1184 aa  59.3  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  34.62 
 
 		 1187 aa  59.3  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  23.94 
 
 		 1162 aa  59.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  21.6 
 
 		 1196 aa  58.9  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.51 
 
 		 1189 aa  58.5  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06390  nucleus protein, putative  21.83 
 
 		 1157 aa  58.9  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  22.55 
 
 		 1162 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  24.29 
 
 		 1219 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  27.92 
 
 		 1207 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.1 
 
 		 1201 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  23.49 
 
 		 1162 aa  57.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  34.78 
 
 		 1183 aa  56.2  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  28.1 
 
 		 1183 aa  56.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  31.4 
 
 		 1202 aa  56.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1184 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 		 1226 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  22.12 
 
 		 895 aa  56.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  33.01 
 
 		 1225 aa  56.2  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 		 1226 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  29.63 
 
 		 554 aa  55.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  33.72 
 
 		 891 aa  55.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  24.04 
 
 		 1189 aa  55.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  22.13 
 
 		 568 aa  55.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  21.36 
 
 		 1167 aa  55.5  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  29.76 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  29.76 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  38.83 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  38.83 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  38.83 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1204 aa  55.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  21.36 
 
 		 1167 aa  55.1  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  38.83 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1196 aa  55.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  21.89 
 
 		 1187 aa  55.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  38.83 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  34.75 
 
 		 1213 aa  55.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  38.83 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  21.91 
 
 		 1193 aa  55.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 		 1187 aa  55.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  34.94 
 
 		 1196 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  34.94 
 
 		 1196 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  34.75 
 
 		 1205 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 586 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1191 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 		 1195 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  20.3 
 
 		 1164 aa  54.3  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  37.86 
 
 		 1189 aa  54.3  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  22.83 
 
 		 1185 aa  54.3  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  24.55 
 
 		 1163 aa  54.3  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  33.9 
 
 		 1222 aa  54.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  36.71 
 
 		 1171 aa  54.3  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  24.4 
 
 		 924 aa  53.9  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  37.86 
 
 		 1189 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.21 
 
 		 415 aa  53.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  37.86 
 
 		 1189 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  33.61 
 
 		 1194 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.18 
 
 		 1177 aa  53.5  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.22 
 
 		 1194 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  31.3 
 
 		 553 aa  53.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  23.87 
 
 		 1196 aa  53.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  34 
 
 		 1172 aa  53.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  23.69 
 
 		 1186 aa  53.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  22.29 
 
 		 582 aa  53.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  28.08 
 
 		 1146 aa  53.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  34.75 
 
 		 1195 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  33.03 
 
 		 693 aa  53.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  34.75 
 
 		 1195 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  34.75 
 
 		 1195 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  33.9 
 
 		 1194 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  33.91 
 
 		 1186 aa  52.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  22.14 
 
 		 1540 aa  52.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  21.55 
 
 		 1172 aa  52.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  22.17 
 
 		 567 aa  52.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 		 1190 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  29.13 
 
 		 912 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1189 aa  52.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1164 aa  52.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  33.05 
 
 		 1203 aa  52.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  25.24 
 
 		 551 aa  52.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  29.82 
 
 		 564 aa  52.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>