More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0586 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  56.82 
 
 		 1019 aa  1012    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  88.82 
 
 		 993 aa  1646    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 993 aa  1909    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  83.28 
 
 		 993 aa  1558    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  38.15 
 
 		 994 aa  533  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.62 
 
 		 858 aa  173  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  18.91 
 
 		 1031 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  29.15 
 
 		 1074 aa  104  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  26.97 
 
 		 864 aa  103  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.71 
 
 		 926 aa  103  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  23.25 
 
 		 1021 aa  101  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.15 
 
 		 924 aa  101  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  35.76 
 
 		 789 aa  101  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  27.98 
 
 		 902 aa  100  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  24.32 
 
 		 891 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  27.92 
 
 		 888 aa  99.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  35 
 
 		 891 aa  99.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  27.53 
 
 		 895 aa  99.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  20.52 
 
 		 1019 aa  98.2  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.13 
 
 		 890 aa  97.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 693 aa  95.1  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  33.13 
 
 		 1057 aa  94  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  28.95 
 
 		 910 aa  93.6  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  24.25 
 
 		 1061 aa  92.4  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  20.22 
 
 		 1022 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  33.67 
 
 		 812 aa  88.6  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  27.64 
 
 		 955 aa  85.9  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  28.77 
 
 		 702 aa  86.3  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  25.36 
 
 		 935 aa  84.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  26.65 
 
 		 859 aa  83.2  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  26.86 
 
 		 859 aa  82.8  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  25.46 
 
 		 1023 aa  82.8  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  28.28 
 
 		 1007 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  32.24 
 
 		 859 aa  81.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  24.65 
 
 		 1009 aa  80.5  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  26.03 
 
 		 702 aa  79  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  26.37 
 
 		 1016 aa  78.2  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  30.39 
 
 		 857 aa  77.8  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  30.39 
 
 		 1234 aa  77  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  28.65 
 
 		 702 aa  76.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  26.85 
 
 		 814 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  22.99 
 
 		 804 aa  76.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  30.11 
 
 		 1232 aa  75.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  25.72 
 
 		 1022 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  26.84 
 
 		 1308 aa  74.3  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  31.43 
 
 		 961 aa  73.9  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  28.96 
 
 		 1226 aa  73.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  30.67 
 
 		 852 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  30.67 
 
 		 852 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  30.81 
 
 		 1232 aa  72  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  30.04 
 
 		 1184 aa  70.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  28.33 
 
 		 906 aa  70.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  32.95 
 
 		 806 aa  70.1  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  24.51 
 
 		 912 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  29.82 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  24.43 
 
 		 1008 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  25.12 
 
 		 802 aa  68.6  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  22.55 
 
 		 1007 aa  68.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  30.29 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  19.9 
 
 		 1008 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  23.61 
 
 		 1008 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  27.37 
 
 		 1049 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  25.93 
 
 		 810 aa  67  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  26.72 
 
 		 978 aa  66.6  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.09 
 
 		 813 aa  66.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  26.67 
 
 		 953 aa  66.2  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 		 1188 aa  65.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  26.63 
 
 		 1047 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  37.5 
 
 		 987 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  22.99 
 
 		 984 aa  65.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  26.37 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  26.37 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  28.17 
 
 		 1108 aa  65.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  26.37 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  25 
 
 		 1227 aa  65.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  26.37 
 
 		 1047 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  26.37 
 
 		 1047 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  27.27 
 
 		 1265 aa  65.1  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  26.67 
 
 		 1303 aa  65.1  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  29.45 
 
 		 805 aa  65.1  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  26.37 
 
 		 1047 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 840 aa  65.1  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  26.37 
 
 		 1047 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28 
 
 		 1134 aa  65.1  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  27.74 
 
 		 1165 aa  64.7  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  29.67 
 
 		 664 aa  64.7  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  26.67 
 
 		 1307 aa  64.7  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  25.49 
 
 		 1180 aa  64.7  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  25.7 
 
 		 1238 aa  64.7  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  25.87 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  27.59 
 
 		 1116 aa  64.3  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  25.9 
 
 		 700 aa  64.3  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  26.47 
 
 		 1189 aa  64.3  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  27.12 
 
 		 1114 aa  64.3  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  22.82 
 
 		 1189 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  24.39 
 
 		 851 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25 
 
 		 1177 aa  63.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.09 
 
 		 1188 aa  63.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  24.71 
 
 		 1155 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>